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批量提取柔性扫描的能量及结构,意义还是有的。但二维扫描的能量和坐标提取都比较麻烦。论坛见过有用perl和python的,但不适合我的使用习惯。个人喜欢自带的awk和sed,啥也不用装。基本原理:通过 Stationary point found 定位每个单点柔扫的结果,在此基础上通过Standard orientation:定位相应坐标。
脚本不长,没使用到特别高级的语句,除了为替换坐标符号用到了gsub。如果有些元素符号没有定义,可依脚本画葫芦。
使用tips:
需要一个/多个柔扫的log文件,把脚本放于当前目录,执行即可,不需要其他参数。使用both.sh,会批量提取能量且批量提取坐标。使用energy.sh可以监测当前扫至哪步。
两个脚本均已测试正确,若不幸存在,还望请告知。
希望能对初学者有所裨益,见笑于诸位old birds。
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both.sh
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eng&stru
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energy.sh
326 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 71
eng-stps
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