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[Gaussian/gview] 批量提取柔性扫描的能量及结构

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发表于 Post on 2020-9-21 16:34:49 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
批量提取柔性扫描的能量及结构,意义还是有的。但二维扫描的能量和坐标提取都比较麻烦。论坛见过有用perl和python的,但不适合我的使用习惯。个人喜欢自带的awk和sed,啥也不用装。基本原理:通过 Stationary point found 定位每个单点柔扫的结果,在此基础上通过Standard orientation:定位相应坐标。

脚本不长,没使用到特别高级的语句,除了为替换坐标符号用到了gsub。如果有些元素符号没有定义,可依脚本画葫芦。
使用tips:
需要一个/多个柔扫的log文件,把脚本放于当前目录,执行即可,不需要其他参数。使用both.sh,会批量提取能量且批量提取坐标。使用energy.sh可以监测当前扫至哪步。
两个脚本均已测试正确,若不幸存在,还望请告知。
希望能对初学者有所裨益,见笑于诸位old birds。

both.sh

1.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 111

eng&stru

energy.sh

326 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 71

eng-stps

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发表于 Post on 2020-10-6 07:25:49 | 显示全部楼层 Show all
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