计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: stecue
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] B3LYP-gCP-D3BJ在Gaussian 09中的关键字

[复制链接 Copy URL]

156

帖子

0

威望

3405

eV
积分
3561

Level 5 (御坂)

16#
发表于 Post on 2019-4-26 01:29:03 | 只看该作者 Only view this author
pcxlm1 发表于 2019-4-25 16:21
sob老师,向您请教。我的命令行是#p opt b3lyp/6-311G(d,p) empiricaldispersion=gd3bj geom=conectivity  ...

geom=conectivity.   conectivity拼错了,应该是connectivity,但完全可以把这个删了,没必要加

22

帖子

0

威望

171

eV
积分
193

Level 3 能力者

17#
发表于 Post on 2019-4-28 16:38:35 | 只看该作者 Only view this author
indec 发表于 2019-4-26 01:29
geom=conectivity.   conectivity拼错了,应该是connectivity,但完全可以把这个删了,没必要加

多谢!

82

帖子

0

威望

510

eV
积分
592

Level 4 (黑子)

18#
发表于 Post on 2019-6-20 09:02:22 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-10-29 12:27
搜。。一。。下。。。

请问对于100个原子的弱相互作用体系做分子动力学,用g-311G*基组,需要加gcp么?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112359

管理员

公社社长

19#
发表于 Post on 2019-6-21 04:35:57 | 只看该作者 Only view this author
huangyoyo 发表于 2019-6-20 09:02
请问对于100个原子的弱相互作用体系做分子动力学,用g-311G*基组,需要加gcp么?

如果你用Gaussian,根本就不能直接用gCP
如果你用ORCA,根本就没人用Pople系列基组
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

98

帖子

0

威望

823

eV
积分
921

Level 4 (黑子)

20#
发表于 Post on 2020-2-11 11:47:52 | 只看该作者 Only view this author
pcxlm1 发表于 2019-4-25 16:21
sob老师,向您请教。我的命令行是#p opt b3lyp/6-311G(d,p) empiricaldispersion=gd3bj geom=conectivity  ...

为啥多加了一个p。。还有connectivity拼写错了吧。。

9

帖子

0

威望

314

eV
积分
323

Level 3 能力者

21#
发表于 Post on 2021-7-1 17:51:35 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我在运行molculs优化构象结构的时候,报错了,报错信息如下:
Running Gaussian: "D:\G09W\g09.exe" gau.gjf gau.out
Thread and Process ID are zero in wsystem: No such file or directory
我检查了out文件,里面也是写着:
# B3LYP/6-31G* em=GD3BJ opt freq int=fine
-----------------------------------------
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
# B3LYP/6-31G* em=GD3BJ opt freq int=fin
                  '
Last state="GCL"
TCursr= 1177 LCursr=   17
这个问题要怎么处理?查到您之前回答说这是Windows版Gaussian的一个 bug, 重启就好。
可是我重启了,也换了一台电脑试了一下还是报这个错误

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18149

Level 6 (一方通行)

22#
发表于 Post on 2021-7-1 19:08:27 | 只看该作者 Only view this author
viycole 发表于 2021-7-1 10:51
sob老师,我在运行molculs优化构象结构的时候,报错了,报错信息如下:
Running Gaussian: "D:\G09W\g09. ...

你用的是G09的哪个distribution?是不是版本太旧了,不支持色散校正
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

9

帖子

0

威望

314

eV
积分
323

Level 3 能力者

23#
发表于 Post on 2021-7-1 22:35:11 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-1 19:08
你用的是G09的哪个distribution?是不是版本太旧了,不支持色散校正

用的是A 02, 我单独拷贝一个构象用Gaussian跑优化没有问题,没有报错,就是和molculs联用的时候报错了

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18149

Level 6 (一方通行)

24#
发表于 Post on 2021-7-1 22:41:22 | 只看该作者 Only view this author
viycole 发表于 2021-7-1 15:35
用的是A 02, 我单独拷贝一个构象用Gaussian跑优化没有问题,没有报错,就是和molculs联用的时候报错了:di ...

你单独跑优化的输入文件,和molclus自动生成的输入文件有什么区别?
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

9

帖子

0

威望

314

eV
积分
323

Level 3 能力者

25#
发表于 Post on 2021-7-2 11:12:47 | 只看该作者 Only view this author
molclus可以方便快捷设置模板输入文件,对结果统一化处理,排重和排序,还可以与其他量子化学计算程序联用,不仅仅是Gaussian
可以看看: Molclus:简便实用的团簇构型和分子构象搜索程序 http://www.keinsci.com/research/molclus.html

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112359

管理员

公社社长

26#
发表于 Post on 2021-7-2 11:25:50 | 只看该作者 Only view this author
viycole 发表于 2021-7-1 17:51
sob老师,我在运行molculs优化构象结构的时候,报错了,报错信息如下:
Running Gaussian: "D:\G09W\g09. ...

Gaussian版本太老
G09 D.01之后才能用DFT-D,仔细看
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

9

帖子

0

威望

314

eV
积分
323

Level 3 能力者

27#
发表于 Post on 2021-7-2 12:25:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-2 11:25
Gaussian版本太老
G09 D.01之后才能用DFT-D,仔细看
DFT-D色散校正的使用

懂了,谢谢老师。

36

帖子

0

威望

391

eV
积分
427

Level 3 能力者

28#
发表于 Post on 2021-12-9 23:11:36 | 只看该作者 Only view this author
万卷书万里路 发表于 2016-9-20 21:31
请问老师,一个类似的体系,我是这样写:
# opt B3LYP-D3(BJ)/6-311+G**
为什么总是报错呢,输入文件应 ...

你好,你报错的原因找到了吗?为什么能解释下吗?

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18149

Level 6 (一方通行)

29#
发表于 Post on 2021-12-10 01:21:06 | 只看该作者 Only view this author
avatar_man 发表于 2021-12-9 16:11
你好,你报错的原因找到了吗?为什么能解释下吗?

在你回复的那楼下面,sob老师已经回了链接解释了
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

16

帖子

0

威望

411

eV
积分
427

Level 3 能力者

30#
发表于 Post on 2024-5-9 16:28:10 | 只看该作者 Only view this author
您好,老师,在计算gcp的网站上上传的.xyz和.log文件后,之后计算结果为0,请问是什么原因?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 19:30 , Processed in 0.168877 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list