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[ORCA] 关于使用ORCA内存内存的建议

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发表于 Post on 2020-10-30 04:30:43 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
本帖最后由 c00jsw00 于 2020-10-30 07:37 编辑

各位前辈我计算的体系约为300个原子左右&外加溶剂模型..16G的内存在使用Multiwfn &ORCA 经常会out of memory ..这一个通常大概要多少比较适合 谢谢
另外还有我有两颗CPU分别有16 CORE但使用ORCA的时候却只能使用单独一颗计算指定32 CORE的时候会出现错误 请问这该如何解决
谢谢

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发表于 Post on 2020-10-30 09:34:59 | 显示全部楼层 Show all
这个大概64G应该差不多,我算过336原子的,B3LYP/def2-SV(P),需要84G内存
专注于面向个人的量化问题解决,LAMMPS ReaxFF力场。一对一提供服务,本人个人电脑提供计算资源,双路8168,128G内存。

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发表于 Post on 2020-10-30 10:44:26 | 显示全部楼层 Show all
可以考虑减小核数,orca很多计算步骤涉及把一个矩阵给每个核拷一份,所以使用内存量随核数增加而增加

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发表于 Post on 2020-10-30 11:02:57 | 显示全部楼层 Show all
orca,32核并行效率低,不如跑俩16核任务

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发表于 Post on 2020-10-30 11:30:41 | 显示全部楼层 Show all
你这个体系用6个核心,每个核心800M-1G

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发表于 Post on 2020-10-30 11:46:04 | 显示全部楼层 Show all
看你算啥,用啥方案?

比如,我计算100多原子体系,每个核心4GB内存都会死。
我指的是TDDFT。
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发表于 Post on 2020-10-30 12:16:25 | 显示全部楼层 Show all
16g内存洗洗睡,也就用得起半经验了

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发表于 Post on 2020-10-30 13:20:14 | 显示全部楼层 Show all
16GB也就跑几十个原子,更何况ORCA这种MPI并行的程序,没法共享内存,涉及到后HF更没戏

第二个问题说具体报错
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-31 03:20:12 | 显示全部楼层 Show all
There are not enough slots available in the system to satisfy the 40
slots that were requested by the application:

  /home/c00jsw00/bin/orca_4_2_1_linux_x86-64_openmpi314/orca_gtoint_mpi

Either request fewer slots for your application, or make more slots
available for use.

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发表于 Post on 2020-10-31 16:20:25 | 显示全部楼层 Show all
c00jsw00 发表于 2020-10-31 03:20
There are not enough slots available in the system to satisfy the 40
slots that were requested by t ...

CPU总共16核*2=32核,你计算要了40核,超了,所以报错了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-1 15:59:06 | 显示全部楼层 Show all
不是樓上說的那樣 我有40 cores:  應該是openmpi的 問題
我更改: openmpi-default-hostfile & 並且寫入 localhost slots=40
就OK了

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