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楼主 Author: liuheng268
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[综合交流] 如何使用ReaxFF计算键解离能或反应过程体系能量变化情况?

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发表于 Post on 2022-2-20 06:59:18 | 只看该作者 Only view this author
TinnKuka 发表于 2022-2-20 05:55
老师您好,我现在正在用Reaxff计算DFT优化的结构的解离能,与DFT计算的解离能作比较。请问我对Reaxff计算 ...

对的。就是分别用DFT和Reaxff扫两个势能曲线,比较下

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发表于 Post on 2022-2-20 08:01:10 | 只看该作者 Only view this author
TinnKuka 发表于 2022-2-19 22:55
老师您好,我现在正在用Reaxff计算DFT优化的结构的解离能,与DFT计算的解离能作比较。请问我对Reaxff计算 ...

BDE只对平衡结构有定义,如果改变了键长,不是平衡结构了,就不存在BDE的概念了。所以不存在“BDE v.s distance曲线”这个东西
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2022-2-21 16:43:20 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-2-20 08:01
BDE只对平衡结构有定义,如果改变了键长,不是平衡结构了,就不存在BDE的概念了。所以不存在“BDE v.s di ...

谢谢老师,那请问在reaxff力场原始文献里bond dissociation曲线是通过改变键长来计算能量得到的吗?

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发表于 Post on 2022-2-21 17:04:27 | 只看该作者 Only view this author
TinnKuka 发表于 2022-2-21 09:43
谢谢老师,那请问在reaxff力场原始文献里bond dissociation曲线是通过改变键长来计算能量得到的吗?

bond dissociation曲线是能量对键长作图,不是BDE对键长作图。这和你关心的BDE是两个概念。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2022-2-21 18:16:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-2-21 17:04
bond dissociation曲线是能量对键长作图,不是BDE对键长作图。这和你关心的BDE是两个概念。

谢谢老师,但我还是不太明白。bond dissociation曲线不是bond dissociation energy吗?(见https://doi.org/10.1021/jp004368u)还是说我们所说的BDE=E(B)+E(C)-E(A)不是bond dissociation energy?谢谢老师耐心解答。

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发表于 Post on 2022-2-21 19:58:24 | 只看该作者 Only view this author
TinnKuka 发表于 2022-2-21 11:16
谢谢老师,但我还是不太明白。bond dissociation曲线不是bond dissociation energy吗?(见https://doi.o ...

你可以看到文献里图的纵坐标是energy,不是bond dissociation energy。所以虽然图的名字里面有bond dissociation的字样,但是纵坐标的名字里没有bond dissociation。
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发表于 Post on 2022-2-21 21:58:15 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-2-21 19:58
你可以看到文献里图的纵坐标是energy,不是bond dissociation energy。所以虽然图的名字里面有bond disso ...

原来如此,所以原始文献中的energy以及这篇文献(https://doi.org/10.1021/jp709896w)中的relative energy都不是bond dissociation energy吗?如果不是的话,只是体系总能量对bond distance作图吗?谢谢老师!

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发表于 Post on 2022-2-21 23:41:31 | 只看该作者 Only view this author
TinnKuka 发表于 2022-2-21 14:58
原来如此,所以原始文献中的energy以及这篇文献(https://doi.org/10.1021/jp709896w)中的relative ener ...

对,一般要么用体系总能量,要么用体系能量减去解离产物的能量之和,要么用体系能量减去平衡位置处的体系能量。
bond dissociation energy是解离产物的能量之和减去平衡位置处的体系能量(这里暂不考虑ZPE等因素),所以解离曲线上只有一个点对应的是bond dissociation energy,也就是平衡位置处,其他点处的能量都不是bond dissociation energy。而且即便是平衡位置处的能量,也不一定直接等于bond dissociation energy,而是取决于作图的时候有没有减别的能量、减的是哪个能量,可能需要一定的换算才能得到bond dissociation energy。

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TinnKuka + 4 谢谢老师!

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发表于 Post on 2022-2-22 05:01:16 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-2-21 23:41
对,一般要么用体系总能量,要么用体系能量减去解离产物的能量之和,要么用体系能量减去平衡位置处的体系 ...

所以只能称它是relative energy。原来如此!多谢老师耐心解答我的疑问,非常感谢!:)

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发表于 Post on 2024-10-29 09:00:08 | 只看该作者 Only view this author
TinnKuka 发表于 2022-2-20 05:55
老师您好,我现在正在用Reaxff计算DFT优化的结构的解离能,与DFT计算的解离能作比较。请问我对Reaxff计算 ...

是的,是这个流程

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