求助：GPU支持的Gromacs2018.4安装总是出错。

lisanoid

liuyuje714 发表于 2021-1-6 16:41
你们真的是够折腾的。。。低于2020.4版本的gromacs自己打个cuda11的补丁不就行了(也就是删除几行的事)。 ...

前辈你好，我用此脚本时出现报错：
patch_cuda11.bsh: line 2: $'\r': command not found
patch_cuda11.bsh: line 3: syntax error near unexpected token `$'\r''
'atch_cuda11.bsh: line 3: `Check_Cuda11()
centos7.6版本，打算杆状的gromacs是2018.8
具体操作是：将代码复制后，在win下新建的txt文档中粘贴，在复制到准备安装gromacs文件夹下的build文件夹，运行命令后即上述报错，请问这个是哪里出现问题了呢？

lisanoid

问题已解决，原因是给的代码里，显示有^M的换行，搜索了一下，发现是win下的文本与linux中的换行符不一致，解决方法是把脚本中内容替换一下，命令
cat patch_cuda11.bsh | tr -s "\r\n" "\n" > cuda.bsh
然后运行新命令就可以继续了。
然后再参考社长博文 http://sobereva.com/457，就可以安装cuda加速的gromacs了