MS建立的模型如何转化为除cvff力场以外的LAMMPS data文件？

panki · 发表于 Post on 2020-11-11 13:54:04

本帖最后由 panki 于 2020-11-11 13:56 编辑

MS建立的模型中含有高分子聚合物和无机物，导出car文件后使用LAMMPS中的msi2lmp工具转化为data文件，试了几个力场文件，好像只有用cvff转换的data文件中有数据（但有缺失），其他的诸如OPLS转的data文件键角什么的都是0。但是我看到的文献有用OPLS和Reax的，请问使用msi2lmp能否实现除了cvff力场以外的data文件的转化，或者有什么其他途径进行导出data文件？

江湖采花贼 · 发表于 Post on 2020-11-11 16:57:21

同求

panki · 发表于 Post on 2020-11-17 19:34:51

顶一下

cx218 · 发表于 Post on 2020-11-19 10:40:43

我是将MS中的模型保存为car.格式然后利用MAPS分配力场导出的data文件，还可以用VMD导出。但是电荷部分都有一点问题，静等大神提供更好的方法。

panki · 发表于 Post on 2020-11-19 16:09:43

cx218 发表于 2020-11-19 10:40
我是将MS中的模型保存为car.格式然后利用MAPS分配力场导出的data文件，还可以用VMD导出。但是电荷部分都有 ...

请问用VMD导出的data文件如何在lammps中运行？我的data文件pair coeffs和bond coeffs等都没有，一直error

cx218 · 发表于 Post on 2020-11-19 16:31:50

可以在输出命令后面加你需要的东西，因为我只需电荷，所以其他的我也没试过

悟小空 · 发表于 Post on 2021-1-12 21:16:44

解决了吗，同求处理方法

长缨乱舞 · 发表于 Post on 2022-2-16 11:07:28

楼主这么问题解决了吗？

nontons · 发表于 Post on 2022-2-16 11:17:33

可以研究一下Atomsk，网站教程很多

hdmd · 发表于 Post on 2022-2-20 01:39:51

msi2lmp真的不好用，学编程+packmol建模是目前lammps最好的选择

lvzhiwei · 发表于 Post on 2024-11-14 17:34:54

cvff.frc在哪下载

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[Lammps] MS建立的模型如何转化为除cvff力场以外的LAMMPS data文件？