请问用NAMD做SMD的输出项是什么意义？

songsong · 发表于 Post on 2015-11-7 01:15:29

用NAMD做SMD时输出中有几项搞不懂：
”IMPRPERS, KINETIC, POTENTIAL, BOUNDARY, MISC“
1. 在拉伸过程中代表什么意义，
2. 是根据什么公式计算得出的，
3. 有相关文献推荐一下。

谢谢！

ruanyang · 发表于 Post on 2015-11-7 07:48:57

Calculating potentials of mean force from steered molecular dynamics simulations https://www.researchgate.net/pub ... dynamics_simulation

songsong · 发表于 Post on 2015-11-7 20:13:06

谢谢了。

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