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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 基于背景电荷计算分子在晶体环境中的吸收光谱

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发表于 Post on 2021-10-31 17:39:02 | 只看该作者 Only view this author
社长,问一下,这个splitwhole小程序,在windows下运行,双击启动,输入gjf路径后回车,直接退出了。。。请问这样操作不对吗?应该是怎么操作呢?

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发表于 Post on 2021-10-31 17:41:30 | 只看该作者 Only view this author
我好像明白了。可能我的初始文件有点问题,我修改一下

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发表于 Post on 2021-11-1 15:26:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-12-24 11:52
那些专门做嵌入方法的人用的模型比起本文的做法复杂很多,目的也不同。据我所了解,没有公开的且直接能与 ...

社长,如何利用文中给的template模板,和http://sobereva.com/258中脚本,批量产生fch文件呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-2 11:13:19 | 只看该作者 Only view this author
annaqz 发表于 2021-11-1 15:26
社长,如何利用文中给的template模板,和http://sobereva.com/258中脚本,批量产生fch文件呢?

看此文了解脚本编写常识
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2021-11-2 12:02:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-2 11:13
看此文了解脚本编写常识
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612(htt ...

好的,我去看一下。谢谢社长

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发表于 Post on 2021-12-20 11:20:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 rendong 于 2021-12-20 11:42 编辑

老师好,我用文中“getCHELPG.sh”脚本得到的bkchg.txt文件中,发现有时坐标(x y z)数字间缺少空格,我找了一下规律,如果y的值是负数且整数部分有两位时,x和y之间没有空格。比如坐标和电荷为(-10.434466 -10.564429 1.324336 0.059337)在bkchg.txt文件中是(-10.434466-10.564429 1.324336 0.059337)想请教老师需要如何修改脚本,谢谢您
补充:重新检查了一遍只有一个数据有这种情况,可能是我有什么地方搞错了,我先自己再找找原因

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发表于 Post on 2024-2-14 17:33:17 | 只看该作者 Only view this author
社长好,我想知道用这个方法计算晶体的吸收光谱和直接用CP2K计算晶体的吸收光谱有什么区别。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-15 13:52:12 | 只看该作者 Only view this author
wwws 发表于 2024-2-14 17:33
社长好,我想知道用这个方法计算晶体的吸收光谱和直接用CP2K计算晶体的吸收光谱有什么区别。


北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里专门讲了



北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-10-20 19:54:32 | 只看该作者 Only view this author
社长,我想请问几个问题:
1. 这种方法能用于离子晶体、或者配位聚合物吗?我之前带上阳离子计算后,导致有机阴离子体系的LUMO轨道不正常地向阳离子位置方向聚集。这种情况在纯阴离子体系是没有的。
2. 背景电荷是以点电荷的形式直接加入吗?还需要加入E值,使其变成高斯分布电荷吗?
3. 对于固体晶体环境,只需要模拟中心分子周围的电荷吗?还需要加入PCM模型,输入介电系数吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-20 23:10:34 | 只看该作者 Only view this author
NewYaren 发表于 2025-10-20 19:54
社长,我想请问几个问题:
1. 这种方法能用于离子晶体、或者配位聚合物吗?我之前带上阳离子计算后,导致 ...

1 可以。没具体体系没法说

2 我不知道E值是什么东西。用Gaussian电荷分布并不总是必须的,虽然可以这样做有益,诸如CP2K就是,可以避免过极化问题,但Gaussian不支持

3 是。不需要
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