写了一个class I 力场的data文件转itp文件的脚本

EdwardLimit · 发表于 Post on 2020-12-25 16:33:15

脚本如附件所示，主要用于由msi2lmp生成的data文件转化为itp文件。

naoki · 发表于 Post on 2020-12-25 19:52:00

cool，学习一下

EdwardLimit · 发表于 Post on 2020-12-26 19:04:35

naoki 发表于 2020-12-25 19:52
cool，学习一下

hhhhhhh![手动抱拳]

EdwardLimit · 发表于 Post on 2020-12-27 15:04:45

做了一点小改进，改进如下:
1. 新增了对二面角和异常二面角的设置
2. 考虑到力场类型和原子名称的差异，将两项分开。
3. 争对电荷的分配写了两种版本，第一种为原子数不多的小分子，整个体系对应一个电荷的列表，第二种为原子数较多的高分子或其他大分子，电荷分配随力场类型分配。

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[GROMACS] 写了一个class I 力场的data文件转itp文件的脚本