利用VMD中的Add ions模块往初始构型里加入离子？

ruanyang · 发表于 Post on 2014-11-7 14:54:27

如题所示，我想知道具体的操作。我不清楚input 即应该输入哪些内容，谢谢！

cyang · 发表于 Post on 2014-11-7 15:05:33

ruanyang · 发表于 Post on 2014-11-7 17:59:34

cyang 发表于 2014-11-7 15:05
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/plugins/autoionize/

我不知怎样得到.psf文件，我只有一个.pdb文件，请指教！谢谢

cyang · 发表于 Post on 2014-11-7 23:09:33

psf文件生成

ruanyang · 发表于 Post on 2014-11-8 07:39:41

谢谢指导

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[VMD] 利用VMD中的Add ions模块往初始构型里加入离子？