[GROMACS] 请教PCBM分子opls-aa力场参数的书写

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发表于 Post on 2021-1-27 21:19:05 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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我想用opls-aa力场模拟P3HT:PCBM的薄膜形貌，PCBM的top文件的立场参数是用附件文章中所提供的，其中有个地方不理解，碳球上的键参数有两种CF-CF5和CF-CF6，我理解是C60中5元环和6元环上C-C键的键参数，但是在PCBM中五元环中的C-C键也是六元环中的C-C键，请问老师这两种键应该怎么区分？

J]HI]D3P}Q4DTV%[A2V1J~D.png (17.55 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

am5b02202_si_001.pdf

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