计算适用于OPLS-AA力场做模拟的1.2*CM5原子电荷的懒人脚本

sobereva · 发表于 Post on 2024-1-22 02:48:13

一条君发表于 2024-1-21 23:41
老师，（1）针对【Na用+1.2明显说不通】延展的一个问题，比如NaPF6，阴离子用了0.8*OPLS-2009IL 的电荷， ...

对一个体系，用诸如1.2、-0.8这样的净电荷，除非有文章证明过对此类体系这种情况的电荷能得到合理结果，否则不要随便用。

xishaofan · 发表于 Post on 2024-11-14 17:34:25

sobereva 发表于 2021-1-29 19:34
笔误改了

Na用+1.2明显说不通。用RESP2明显有意义得多

sob老师，请问
1）针对带电的十二烷基磺酸根，RESP2电荷计算是更合理，有没有文献支撑呀
2）若十二烷基磺酸根用RESP2电荷计算，其抗衡离子钠离子，可以直接使用opls力场文件里面的ions.itp中的钠离子参数吗？如果不可以，也要用RESP2电荷去计算吗？

sobereva · 发表于 Post on 2024-11-15 04:53:23

xishaofan 发表于 2024-11-14 17:34
sob老师，请问
1）针对带电的十二烷基磺酸根，RESP2电荷计算是更合理，有没有文献支撑呀
2）若十二烷基 ...

1 没有。只能告诉你从原理上这是合适的

2 Na+的原子电荷只能为1.0，这是显而易见的，没什么可“计算”的

xishaofan · 发表于 Post on 2024-11-15 09:56:14

sobereva 发表于 2024-11-15 04:53
1 没有。只能告诉你从原理上这是合适的

2 Na+的原子电荷只能为1.0，这是显而易见的，没什么可“计算” ...

谢谢sob老师

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[综合交流] 计算适用于OPLS-AA力场做模拟的1.2*CM5原子电荷的懒人脚本