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[综合交流] 量子统计力学与动力学2:虚时间路径积分分子动力学

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发表于 2021-3-5 14:34:05 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 wxhwbh 于 2021-3-5 14:39 编辑

量子统计力学与动力学1:路径积分简介
这一次主讲PIMD,并给了一个模型计算例子。其实原本设计的示例有好几个,但实在没有时间做完。现在这个例子也比原来预想的缺少normal-mode PIMD的结果,看以后有没有机会补上吧。跟之前一样,欢迎大家交流、指点、建议。
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发表于 2021-3-12 15:30:22 | 显示全部楼层
老师你好,现在有各种各样的动力学模拟,作为一个刚刚接触动力学的小硕还是区分不开。我主要做NAMD,但是总有人问非绝热动力学模拟和经典动力学有啥区别,似乎NAMD模拟的结果,激发态势能面分析也可以说明,所以想请问您NAMD和经典动力学有啥区别优势?还有您是如何学习NAMD的,有没有什么书籍推荐?

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 楼主| 发表于 2021-3-12 16:24:51 | 显示全部楼层
本帖最后由 wxhwbh 于 2021-3-12 16:41 编辑
元气蛋 发表于 2021-3-12 15:30
老师你好,现在有各种各样的动力学模拟,作为一个刚刚接触动力学的小硕还是区分不开。我主要做NAMD,但是总 ...

恰好昨天论坛里有个类似的问题,有很多讨论。我也有回复:
http://bbs.keinsci.com/thread-21981-1-1.html
NAMD跟MD相比不是有什么"优势",而是更“适合”研究什么问题。如果多个电子态之间出现了势能面交叉,那么理论上体系可以在不同的势能面之间窜越,那么当前问题就涉及到了多个电子态的性质。比如说偶氮苯的光异构化,是顺式体系状态被激发到激发态后,运动到基态与激发态的锥形交叉(conical intersection)位置,回落到基态的时候体系波包会分裂,一部分回到顺式基态极小点,另一部分运动到反式基态极小点,这样就实现了光异构化。
激发态势能面的分析当然是有局限性的,就比如说上面光异构化这个例子,只通过势能面分析是很难判断异构化过程后顺式/反式的比例,这种时候就需要动力学模拟来分析。另外,只考虑单个势能面的量子动力学时有时会有所谓的几何相位效应(可参考新墨西哥州大学的郭华老师的工作),其实就是因为这些位置出现了势能面交叉,这是考虑单个势能面的局限性。
如果你已经有MD的基础知识,只是对非绝热动力学不了解的话,我建议可以先读一些综述,比如兰峥岗老师的这篇:
http://www.whxb.pku.edu.cn/EN/10.3866/PKU.WHXB201801042
并接着读他引用的一些文献。至于书的话,我最早是读了Gatti等的Application of Quantum Dynamics in Chemistry的部分章节,学习了一些绝热/透热表象和非绝热过程的基础理论。但这个书对理论要求比较高,不建议新人读(你要是对自己的数学有信心可以一试)。业内公认的经典应该还是Domcke,Yarkony等的Conical Intersections: Theory, Computation and Experiment。这个专栏之后也会介绍非绝热动力学的相关理论,当然我不保证什么时候才能写完。

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发表于 2021-3-12 21:41:18 | 显示全部楼层
wxhwbh 发表于 2021-3-12 16:24
恰好昨天论坛里有个类似的问题,有很多讨论。我也有回复:
http://bbs.keinsci.com/thread-21981-1-1.ht ...

非常感谢您的回复,我先学习下您推荐的综述,谢谢您的帮助

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 楼主| 发表于 2021-3-12 21:49:10 | 显示全部楼层
元气蛋 发表于 2021-3-12 21:41
非常感谢您的回复,我先学习下您推荐的综述,谢谢您的帮助

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