求助：用gromacs模拟金与水的界面如何使金处于负电势？

邱美佳 · 发表于 Post on 2021-3-8 11:43:41

我想用gromacs模拟金与水的界面，请问如何使金处于负电势而不是中性的呢？

cheviax · 发表于 Post on 2021-3-8 15:19:57

设置电势需要改源代码，加原子电荷就行了

邱美佳 · 发表于 Post on 2021-3-8 20:13:16

cheviax 发表于 2021-3-8 15:19
设置电势需要改源代码，加原子电荷就行了

请问原子电荷加在哪里比较合适呢？需要均匀分布吗？还是加在其中一个原子上？

bobosiji · 发表于 Post on 2021-3-9 08:53:16

邱美佳发表于 2021-3-8 20:13
请问原子电荷加在哪里比较合适呢？需要均匀分布吗？还是加在其中一个原子上？

均匀分布在表面的原子上？内部原子可以加电荷么？记得内部电势应该是0来着？

cheviax · 发表于 Post on 2021-3-9 10:55:35

邱美佳发表于 2021-3-8 20:13
请问原子电荷加在哪里比较合适呢？需要均匀分布吗？还是加在其中一个原子上？

一般是均匀加在表面的原子上

邱美佳 · 发表于 Post on 2021-3-9 11:05:40

cheviax 发表于 2021-3-9 10:55
一般是均匀加在表面的原子上

好的，非常感谢！

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