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[波函数分析交流] 拟合静电势电荷的计算方法

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发表于 2014-11-9 08:15:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
这篇文章专门介绍拟合静电势电荷的原理、特点,对于MK、CHELPG、RESP、AM1-BCC等各种拟合静电势电荷都专门进行了介绍和讨论。

拟合静电势电荷的计算方法.pdf (50.53 KB, 下载次数: 653)

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发表于 2015-3-3 09:19:28 | 显示全部楼层
非常感谢。
npa电荷 mullekin电荷和半径无关,设定半径计算chelpg电荷不,会改变npa和mullekin电荷
python perl学习,推荐微信公众号 pythonperl

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发表于 2016-1-7 00:00:51 | 显示全部楼层
Sob前辈,我会用到您的文章里提到的CHELP-BOW方法。此方法的课题组主页上有,但是链接失效,不能下载;和开发者联系,也无果。因此想自己写程序,请问这会不会是一个复杂的程序?

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 楼主| 发表于 2016-1-7 00:07:49 | 显示全部楼层
肖富贵 发表于 2016-1-7 00:00
Sob前辈,我会用到您的文章里提到的CHELP-BOW方法。此方法的课题组主页上有,但是链接失效,不能下载;和开 ...

勤快点的话估计也不难,主要就是引入了拟合点的权重函数,没法像一般拟合静电势电荷那样通过矩阵运算一下子就得到,而需要通过非线性优化算法来拟合,这有一些现成的库可以用。
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发表于 2016-1-7 00:11:52 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2016-1-7 00:07
勤快点的话估计也不难,主要就是引入了拟合点的权重函数,没法像一般拟合静电势电荷那样通过矩阵运算一下 ...

多谢多谢多谢Sob前辈.

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发表于 2016-1-18 13:46:01 | 显示全部楼层
感谢老师的共享

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发表于 2017-5-23 13:38:43 | 显示全部楼层
感谢您的分享!

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发表于 2017-8-4 16:11:11 | 显示全部楼层
请教.jpg 后面说的4.5节DDEC方法,,哪里有介绍啊,谢谢

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 楼主| 发表于 2017-8-4 20:49:10 | 显示全部楼层
WZH1233 发表于 2017-8-4 16:11
后面说的4.5节DDEC方法,,哪里有介绍啊,谢谢

J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 2455–2468
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发表于 2017-9-12 15:30:11 | 显示全部楼层
sob:
看了文章,学了很多。
现在,想看Ref73.Ref78.Ref86进一步阅读一下。

查了一下,请帮忙看一下是不是对应的73,86两个文献。
另外,能不能把Ref78的题目给一下。



Ref73
@article{doi:10.1021/j100494a019,
author = {Momany, Frank A.},
title = {Determination of partial atomic charges from ab initio molecular electrostatic potentials. Application to formamide, methanol, and formic acid},
journal = {The Journal of Physical Chemistry},
volume = {82},
number = {5},
pages = {592-601},
year = {1978},
doi = {10.1021/j100494a019},
}


Ref86

@article{Horn2006,
  doi = {10.1007/s00894-006-0137-8},
  url = {https://doi.org/10.1007/s00894-006-0137-8},
  year  = {2006},
  month = {aug},
  publisher = {Springer Nature},
  volume = {13},
  number = {2},
  pages = {381--392},
  author = {Anselm H. C. Horn and Timothy Clark},
  title = {Multipole electrostatic potential derived atomic charges in {NDDO}-methods with spd-basis sets},
  journal = {Journal of Molecular Modeling}
}

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 楼主| 发表于 2017-9-12 16:29:44 | 显示全部楼层
meatball1982 发表于 2017-9-12 15:30
sob:
看了文章,学了很多。
现在,想看Ref73.Ref78.Ref86进一步阅读一下。

是。

[78] Franc, M. M., Chirlian, L. E. Reviews in Computational Chemistry. Lipkowitz, K. B.; Boyd, D. B., Eds. VCH Publishers: New York, 2000; Vol. 14, pp 1-31.
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发表于 2017-9-12 20:35:32 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2017-9-12 16:29
是。

[78] Franc, M. M., Chirlian, L. E. Reviews in Computational Chemistry. Lipkowitz, K. B.; B ...

谢sob.
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