膜蛋白大体系如何长时间模拟（全原子模拟不现实？）

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-10-11 17:34:35

k64_cc 发表于 2021-10-11 13:32
就GMX的架构设计而言，intermolecular interaction部分放哪都差不太多。你有做过同其他软件的benchmark吗 ...

并没有，只会用Gromacs和Lammps，而且Lammps属于入门级

Kamala · 发表于 Post on 2021-12-15 20:31:06

Kamala 发表于 2021-8-7 20:04
楼主你的tleap文件可是分享一下吗。我用charmm_gui做出来的膜蛋白体系，用charmmlipid2amber.py转化后 ...

兄弟你简直问道我心坎上了，请问最后有解决这个问题吗

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[粗粒化/DPD] 膜蛋白大体系如何长时间模拟（全原子模拟不现实？）