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[VASP] 求助:关于VASPsol 使用细节问题

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本帖最后由 Tanmin 于 2021-5-25 23:07 编辑


a. 在使用VASPsol时,设置关键词LSOL = .TRUE. ,默认是相对介电常数为80的水作为隐式溶剂,此处若研究特定有机溶剂体系,是否需将关键词EB_k改为对应溶剂的介电常数值? 如果不知所研究体系的介电常数,能否采用该默认值,讨论吸附强弱问题?

b. 此外关键词TAU是关于表面张力,将TAU=0 是忽视cavitation energycontribution (暂时还不太清楚该含义),那是不是如果有特定溶剂,需要将TAU设为该溶剂的表面张力值?

c. VASPsol 手册中有这么一段内容:
   Furthermore, if you shift the electrostatic potential to align thepotential in the electrolyte region to zero, or any other value, you also needto add a correction to the energy of your system. This correction is given by QV, where  Q is the net charge of thesimulation cell and V the shift in reference potential, e.g.,V = FERMI_SHIFT.
其中Q是否无需设置?比如根据POTCAR中各元素价电子数,我算出体系总价电子20,将NELECT=22 以考虑-2 价的阴离子在表面的吸附。是否此处自动Q即设为 2 ,而无需在INCAR 单独设置Q=2

d. 最后针对带电离子的吸附问题,在VASP常规优化任务基础上,是否加以下关键词即可:
NELECT = **    # 说明带电情况
LSOL = .TRUE.  #开启溶剂化
V = FERMI_SHIFT # 开启能量校正,此处见论坛有群友谈及需要上下表面对称,如果研究对象是石墨烯,还需要考察其他问题么

另外一个小的想法,不知是否正确,请各位指点:
假如研究无机熔盐体系,以NaF-AlF3为例,在1000℃下, 假设体系中形成 AlF5[2-], 熔盐整体其实为中性,AlF5[2-] 之所以为-2价是因为从Na那里得了2个电子,如果AlF5周边有其他物质与它存在电荷转移,它就无需从Na那里得电子,那么我是不是可以将AlF5[2-]吸附问题简化为AlF5的吸附问题,进而比较AlF3, AlF4,  AlF5 在某材料表面吸附差异?




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发表于 Post on 2021-5-26 09:27:10 | 只看该作者 Only view this author
a、默认是水的介电常数,按道理应该修改为有机溶剂的介电常数。
b、TAU应该是非静电贡献部分的参数,这个可能需要看VASPsol原始文献的定义。
c、Q应该不用设置,印象中Q似乎不是个参数,而是需要手动根据给出来的FERMI_SHIFT和你体系的过剩电荷值去计算。FERMI_SHIFT是计算完成会输出的结果,而不是设定值。
d、石墨烯的话其实搞上下对称的表面似乎不大容易,上下都吸附好像也不太符合实际的情况。

我的看法是,如果AlF5[2-]的两个电子来自于Na,可以用Na作为抗衡离子;如果其他离子作为电子的给体也可以考虑用其他离子,这样避免体系带电荷,而不是简单只是放AlF5。

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发表于 Post on 2021-10-20 19:19:41 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2021-5-26 09:27
a、默认是水的介电常数,按道理应该修改为有机溶剂的介电常数。
b、TAU应该是非静电贡献部分的参数,这个 ...

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发表于 Post on 2022-4-29 18:56:10 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 阿司匹林泡腾片 于 2023-7-19 15:01 编辑

LRHOB=TRUE打开会产生一个RHOION文件类似CHGCAR,可以用VESTA打开看

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发表于 Post on 2023-11-9 15:31:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 qmlearner 于 2023-11-9 15:40 编辑
卡开发发 发表于 2021-5-26 09:27
a、默认是水的介电常数,按道理应该修改为有机溶剂的介电常数。
b、TAU应该是非静电贡献部分的参数,这个 ...

请问卡老师,楼主这个体系,用Na作为抗衡离子的话,实际操作中就是在模型中放一个AlF5,一个Na在材料表面,然后按常规优化吸附模型吗?算AlF5吸附能时要怎么做呢?是Eads=E(surf+AlF5+Na)-Esurf-E(AlF5+Na)吗?(E(AlF5+Na)通过直接删除表面单点计算获得吗?)
另外如果加了抗衡离子的话,可以不考虑溶剂了吗?

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发表于 Post on 2023-11-21 01:16:35 | 只看该作者 Only view this author
qmlearner 发表于 2023-11-9 15:31
请问卡老师,楼主这个体系,用Na作为抗衡离子的话,实际操作中就是在模型中放一个AlF5,一个Na在材料表面 ...

如果只是得到吸附构型,这没问题,如果要得到单独的AlF5这种办法其实也行不通。
抗衡离子只是维持电中性,溶剂化是另一回事。
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发表于 Post on 2023-11-22 10:39:36 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2023-11-21 01:16
如果只是得到吸附构型,这没问题,如果要得到单独的AlF5这种办法其实也行不通。
抗衡离子只是维持电中性 ...

谢谢卡老师的回复。最近需要计算一个阳离子在金属氧化物某个晶面的吸附能,看了很多帖子,感觉不太好解决啊。尝试用簇模型,但是金属氧化物表面结构的簇模型实在是门大学问,一时半会没解决。请问算离子在表面吸附能的问题有没有什么好的处理方法呢?

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发表于 Post on 2023-11-22 16:54:55 | 只看该作者 Only view this author
qmlearner 发表于 2023-11-22 10:39
谢谢卡老师的回复。最近需要计算一个阳离子在金属氧化物某个晶面的吸附能,看了很多帖子,感觉不太好解决 ...

对vasp来说可能有一些修正方案,比方SCPC,我没有详细测试过,到底多可靠我也很难说,按说存在溶剂的情况问题会少很多。
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发表于 Post on 2023-11-23 10:10:27 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2023-11-22 16:54
对vasp来说可能有一些修正方案,比方SCPC,我没有详细测试过,到底多可靠我也很难说,按说存在溶剂的情况 ...

谢谢老师,我去学习一下。另外,这类问题用CP2K是否可靠呢?我的体系是一个一价的金属离子在氧化物表面的吸附,CHARGE设置为1,真空中优化(加了溶剂收敛不了),然后计算吸附能,这样的话投文章有没有问题呢?

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发表于 Post on 2023-11-23 10:49:47 | 只看该作者 Only view this author
qmlearner 发表于 2023-11-23 10:10
谢谢老师,我去学习一下。另外,这类问题用CP2K是否可靠呢?我的体系是一个一价的金属离子在氧化物表面的 ...

我不太确定。
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发表于 Post on 2023-11-23 15:40:32 | 只看该作者 Only view this author

谢谢卡老师啦。保险起见我还是用vasp在模型中加一个抗衡离子,然后加隐式溶剂计算了:)

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