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[GROMACS] pdb2gmx生成PMMA的top文件显示没有 No default angle types

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Level 4 (黑子)

我之前使用pdb2gmx成功生成了聚合度为100的pva的聚合物链,然后用同样的方法想生成聚合度为40的pmma的链,成功生成top后,进行能量最小化的时候出现错误:No default Angle types,错误数量刚好是40。这个错误原因是因为这个单体比较复杂,rtp文件里面需要加入角度和二面角的信息吗?附件是我写的rtp,hdb文件,对应的pdb文件,以及itp文件,希望各位老师帮忙看看。

PMMA40.hdb

317 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 7

PMMA40.pdb

49.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 8

PMMA40.rtp

4.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 10

pmma40.itp

179.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 8

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