[GROMACS] 求助：在核酸模拟中，gromacs的力场包中如何添加5‘端的P、OP1、OP2 原子的拓扑

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发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author

Freyal 发表于 2024-11-15 16:58
您好，请问一下您这个末端P原子不能识别的问题解决了嘛

你好，我最后选择用的是amber14sb_parmbsc1.ff力场，把P原子删除了。你可用charmm36力场自己做末端，可以看这个帖子：http://bbs.keinsci.com/thread-46682-1-1.html。然后再注意把OP1改成O1P

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