orca5.0 优化有机镍配合物出错

huozhong

wzkchem5 发表于 2021-7-14 17:30
串行就是不写%pal那一行，等于用一个核跑。。。

我试了串行（删掉%pal那一行），果然不报错了（跑了五分钟，还在运行），但是我这个镍配合物有103个原子，这样一个核跑是不是很耗时（现在设置的是10G内存，单核）！

有什么办法能够多核跑吗？ 感谢！！

wzkchem5

huozhong 发表于 2021-7-14 10:39
我试了串行（删掉%pal那一行），果然不报错了（跑了五分钟，还在运行），但是我这个镍配合物有103个原子 ...

你看一下这个帖子，https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=9&t=7566
里面提的解决方法都试一遍，如果仍然不行，在那个主题帖底下发个帖子，详细说明你这个问题的情况，我们这边的人会帮你解决

Novice

楼上给的链接https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=9&t=7566有相关报错，如果你用的是Ubuntu，需要先安装gfortran再编译Openmpi，以下是相关楼层的讨论内容:
If there is no gfortran around on the machine it will not do the "Build MPI Fortran bindings" part.
So in Ubuntu just run: "sudo apt-get install gfortran" and then re-compile OpenMPI like you did in the first place, worked for me.
我在Ubuntu20.04安装Orca5.0并行的时候遇到了和你一样的报错，先安装gfortran再编译Openmpi后，成功并行orca5.

huozhong

Novice 发表于 2021-7-14 19:01
楼上给的链接https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=9&t=7566有相关报错，如果你用的是Ubuntu，需 ...

非常感谢，在按照链接里的方法排查。我用的是CentOS8,在vmware下安装的，8核40G内存，感谢回复

yaochuang

huozhong 发表于 2021-7-14 21:13
非常感谢，在按照链接里的方法排查。我用的是CentOS8,在vmware下安装的，8核40G内存，感谢回复

您好，请问您的问题解决了吗？我也遇到相同的问题，我发现原子超过25就会出现这样的问题，小于25个原子的运行正常。好奇怪啊，不知道怎么解决

renzhogn424

yaochuang 发表于 2021-8-7 11:46
您好，请问您的问题解决了吗？我也遇到相同的问题，我发现原子超过25就会出现这样的问题，小于25个原子的 ...

看看是不是内存占用满了。。。

huozhong

yaochuang 发表于 2021-8-7 11:46
您好，请问您的问题解决了吗？我也遇到相同的问题，我发现原子超过25就会出现这样的问题，小于25个原子的 ...

改回orca 4.2.1了，不想用orca5。

huozhong

renzhogn424 发表于 2021-8-7 19:48
看看是不是内存占用满了。。。

应该不是

wzkchem5

huozhong 发表于 2021-8-22 01:59
改回orca 4.2.1了，不想用orca5。

你装了gfortran仍然没有解决吗？
如果是的话，建议在orca论坛上报一下问题，如果遇到问题就不用的话，即使是我们orca团队的问题，我们也没办法改进啊

wzkchem5

yaochuang 发表于 2021-8-7 04:46
您好，请问您的问题解决了吗？我也遇到相同的问题，我发现原子超过25就会出现这样的问题，小于25个原子的 ...

看你楼上我发的链接，先检查有没有装gfortran，如果装了gfortran还是解决不了，把我发的那个主题帖里的所有办法都试一下