计算分子荧光和磷光：Dalton程序示例

yang_lzu

各位大神，我想请问dalton是怎么安装的？之前在window下用cmake产生了install文件夹，但是后面就不知道怎么弄了。再后来在linux（ubuntu）里面也弄了，还是没成功。是不是这个不能在window下运行（在它的论坛上找到这么一句话），但是下载的时候又有zip的压缩包啊，求大神指条明路啊。

sobereva

yang_lzu 发表于 2018-5-2 11:43
各位大神，我想请问dalton是怎么安装的？之前在window下用cmake产生了install文件夹，但是后面就不知道怎么 ...

CentOS 7.2，root，gfortran，机子有MKL

串行版编译：
./setup --prefix=/sob //会安装到/sob/dalton下面。默认用gfortran和gcc
cd build
make install -j
ctest -j //同时测试四个任务，每个任务串行计算

并行版编译：
安装openmpi：./configure --prefix=/sob/openmpi202; make all install （用-j没用，并不会并行编译）
然后把openmpi目录下的bin、lib加入到PATH和LD_LIBRARY_PATH里
./setup --mpi --prefix=/sob
cd build
make install -j （四核的话8分钟编译完毕，36核的话不到一分钟编译完毕）

把此加入到.bashrc：
export PATH=$PATH:/sob/dalton
export DALTON_TMPDIR=/sob2 则之后临时文件都产生在/sob2/DALTON_scratch_root目录下
export DALTON_LAUNCHER="mpirun -np 36 --allow-run-as-root"
export LSDALTON_LAUNCHER="mpirun -np 36 --allow-run-as-root"

重新进入shell之后可以在build目录下运行ctest进行测试，会一次运行一个任务，并行执行。458个任务悉数通过

Windows下在虚拟机中编译同上。
Windows下你用Cygwin用相同方式编译应当也没问题

yang_lzu

好勒，非常感谢社长答贴，我再试试

研道

真棒

小桥流水1102

感谢 大神，学习一波~

linqiaosong

beefly大佬，我在dalton的论坛上询问了系数3的问题，对方给出的回复如下：

For transitions between non-degenerate states, the general rule for the total transition rate is to average initial states and sum over final states. In the most common picture with a T->S transition, an ensemble average over the triplet states,assuming they are equally populated, shows up as a factor 1/3
http://forum.daltonprogram.org/v ... 65&p=6688#p6688

所以或许这个3并不能称之为程序bug，以及输出结果应当是合理的。

beefly

linqiaosong 发表于 2020-2-10 18:05
beefly大佬，我在dalton的论坛上询问了系数3的问题，对方给出的回复如下：

所以或许这个3并不能称之为程 ...

对于T-S0跃迁，公式4.1的分子d'=3，分母f_tot是三重态三个分支f之和，若假设三个分支的f相同（f_tot = 3f），可以得到T态每个分支的寿命就是T态整体寿命。Dalton作者好像是把f理解为f_tot了。

公式4.1是赫兹堡第一卷给的，做小分子高分辨光谱的人广泛在用，可以跟实验测量值比较。做光化学的人可能对公式理解有误，或者简并态寿命的定义不一样。

gaussion

请问对于含过渡族金属Ir/Au/Pt等大原子的分子，如何算跃迁偶极矩，求大佬点播~

wzkchem5

gaussion 发表于 2023-4-25 15:35
请问对于含过渡族金属Ir/Au/Pt等大原子的分子，如何算跃迁偶极矩，求大佬点播~

用全电子相对论基组，搭配显式相对论方法（至少ZORA，最好X2C），并且考虑旋轨耦合。其他方面和纯有机体系没什么区别

kaige

谢谢分享