关于限制的问题求助

sun666 · 发表于 Post on 2021-8-16 20:57:07

本帖最后由 sun666 于 2021-8-16 21:39 编辑

请教老师在gromacs使用[distance_restraints ],函数形式应为下图
;ai aj type    index    type' low up1 up2    fac（力常数乘的系数） (low、up1、up2分别为r0 r1 r2)
10 16 1       0          1       0.0 0.3 0.4    1.0

对于这个形式，type与type' 有什么区别呢，  fac项时力场数乘的系数。力场数又是在哪里设置的呢

sobereva · 发表于 Post on 2021-8-16 22:13:03

手册里都有明确说明。没特殊情况type、type'都设1。力常数通过mdp里的disre-fc设置

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