求助GHARMM-GUI网页的PBEQ模块生成的静电势的单位

金水河的春天 · 发表于 Post on 2021-9-9 00:57:02

你好，

我用GHARMM-GUI网页的PBEQ模块生成的了一个有静电势值的.dx文件，想把静电势的单位换算成能量单位kcal/mol。

请问一下.dx文件中静电势的单位是kcal/(mol*e)吗？如果是的话，单位中的e是什么值？

.dx文件中的静电势有正值也有负值。在一些文献中看到，换算单位后的静电势值只有正值。想请问一下换算单位后静电势是仍然有正负值吗？

sobereva · 发表于 Post on 2021-9-9 01:26:17

用什么单位是计算程序决定的，和格式完全没关系
e=elemenary charge
静电势的量纲是：能量/单位电荷。但习俗上往往把单位电荷给省掉（通常都是e），所以根本就没有从kcal/mol/e换算成kcal/mol这种说法，本来就是一码事

换不换算不可能影响数值的正负号

金水河的春天 · 发表于 Post on 2021-9-9 10:23:55

谢谢卢老师的答复

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[综合交流] 求助GHARMM-GUI网页的PBEQ模块生成的静电势的单位

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