计算分子间电荷转移积分的懒人脚本transint.sh

winnerwill

好几个坛友发布了关于分子间电荷转移积分的程序。

1. @snljty # http://bbs.keinsci.com/thread-23418-1-1.html
   
2. @Warm_Cloud # http://bbs.keinsci.com/thread-14311-1-1.html
   
3. @让你变成回忆 # http://bbs.keinsci.com/thread-11369-1-1.html

复制代码

假如Linux下安装有任意这些程序，可以使用这里提供的一个调用这些程序进行计算的懒人脚本。
脚本的使用要求：

• 输入文件仅需三个fchk文件。
• 脚本会自动调用Gaussian或Multiwfn计算补齐上述程序ElecCoupling.py、CT.x、calc_coupling.x所需的.log文件或者.47文件。
• 使得原先不直接支持的ElecCoupling.py、CT.x也支持。
• 如果使用的是g09，需要把脚本中的g16相应改过来。
• 也支持molden文件作为输入文件，这时仅支持@snljty的程序calc_coupling.x，调用的是Multiwfn。
• 使用如有异常，参照原程序进行安装调试。调用的程序确保均可以通过PATH环境变量中找到并且具有可执行权限。
  

1. transint.sh [args]
   
2. transint.sh <dimer.fchk> <monomer1.fchk> <monomer2.fchk> <functional>

复制代码

如果输入文件为默认文件名，那么无需输入参数。

执行完，屏幕输出如下结果（输出结果是一致的！示例文件来自@snljty程序）：