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[综合交流] 18碳环(cyclo[18]carbon)与石墨烯的相互作用:基于簇模型的研究一例

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发表于 Post on 2021-9-18 07:34:00 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
18碳环(cyclo[18]carbon)与石墨烯的相互作用:基于簇模型的研究一例

文/Sobereva@北京科音  2021-Sep-18



1 前言

自从2019年Science, 365, 1299 (2019)报道在凝聚相观测到18个碳组成的环状体系18碳环(cyclo[18]carbon)之后,碳环类体系一直是研究的热点,笔者做了大量研究并发表过一系列工作,汇总见http://sobereva.com/carbon_ring.html,目前还有相关研究正在进行中。2020年底笔者读到一篇Iyakutti等人发表的研究18碳环和12碳环与石墨烯相互作用的理论计算文章:Materials Science and Engineering: B, 263, 114895 (2021)。这个研究题材不错,我却惊讶地发现此文里的问题比《我对一篇存在大量错误的J.Mol.Model.期刊上的18碳环研究文章的comment》(http://sobereva.com/584)里我评论的那篇文章存在的问题还严重得多。于是笔者很快写了一篇文章,其中一半内容是对Iyakutti等人文章里严重问题的斧正,避免误人子弟,另一半内容是我在真正合理的模型下用准确可靠的方法对18碳环与石墨烯相互作用进行探究并提出我的观点。此文于投出去后经过长达约9个月的漫长审稿,近期已经被接收并发表:Materials Science and Engineering: B, 273, 115425 (2021) https://doi.org/10.1016/j.mseb.2021.115425。在2021年10月19日之前可以使用此链接免费阅览:https://authors.elsevier.com/a/1dfyA3HXllBg4w,欢迎大家阅读。
Comment on 18 and 12 – Member carbon rings (cyclo[n]carbons) – A density funct.pdf (2.07 MB, 下载次数 Times of downloads: 94)

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发表于 Post on 2021-9-18 08:36:29 | 显示全部楼层 Show all
看完了sob老师的帖子,我还有个小疑问:像这种石墨烯簇模型的饱和H和边缘C究竟是同时冻结好还是只冻结边缘C好,全部冻结的话H相当于未弛豫。难道是这两种做法区别不是很大么?

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发表于 Post on 2021-9-18 08:55:05 | 显示全部楼层 Show all
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发表于 Post on 2021-9-18 09:25:15 | 显示全部楼层 Show all
2s4都能出来 从编辑到审稿人莫不是集体瞎了眼

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发表于 Post on 2021-9-18 10:49:05 | 显示全部楼层 Show all
社长,如果用cp2k分子动力学模拟孔材料吸附有机小分子,用哪个泛函比较好?

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发表于 Post on 2021-9-18 14:11:50 | 显示全部楼层 Show all
s轨道占据4个电子。计算界一朵的奇葩

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发表于 Post on 2021-9-18 14:19:52 | 显示全部楼层 Show all
fineren 发表于 2021-9-18 10:49
社长,如果用cp2k分子动力学模拟孔材料吸附有机小分子,用哪个泛函比较好?

PBE+D3就可以了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-19 05:18:53 | 显示全部楼层 Show all
fineren 发表于 2021-9-18 10:49
社长,如果用cp2k分子动力学模拟孔材料吸附有机小分子,用哪个泛函比较好?

PBE、SCAN、TPSS加DFT-D3(BJ)都可以,哪个最好不一定,反正都不会太差,其中PBE最便宜,可以优先考虑
顺带一提,算单点的时候也可以用B97M-rV,大概率比上面的更好。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-19 05:37:38 | 显示全部楼层 Show all
丁越 发表于 2021-9-18 08:36
看完了sob老师的帖子,我还有个小疑问:像这种石墨烯簇模型的饱和H和边缘C究竟是同时冻结好还是只冻结边缘C ...

H也冻结则需要在此之前把H的位置进行优化,帖子里也专门做了这一步

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丁越 + 3 谢谢

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发表于 Post on 2021-9-21 05:56:08 | 显示全部楼层 Show all
阿Q的5.4版本似乎有VV10的解析hessian了

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发表于 Post on 2021-9-22 02:03:46 | 显示全部楼层 Show all
目瞪狗呆(ˉ▽ˉ;)...

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发表于 Post on 2021-9-22 02:14:12 | 显示全部楼层 Show all
我比较好奇的是又说键长一样又说是单三键交替确定不是精神分裂??

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-22 07:07:02 | 显示全部楼层 Show all
喵星大佬 发表于 2021-9-22 02:14
我比较好奇的是又说键长一样又说是单三键交替确定不是精神分裂??

我也觉得是,作者的头脑真是一团浆糊。这样的文章能在这样档次的刊物发出来真是神奇
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发表于 Post on 2021-10-27 15:14:42 | 显示全部楼层 Show all

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-28 12:02:50 | 显示全部楼层 Show all
jsj2020 发表于 2021-10-27 15:14
ORCA输入文件失效了
http://sobereva.com/attach/615/counterpoise.inp

之前忘上传了。已上传
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