VASP计算Pd-C3N4表面吸附OH后与NO以及NO2反应结构的搭建求助

淼飍 · 发表于 Post on 2021-9-21 17:39:52

各位老师，最近我在计算Pd-C3N4表面上Pd吸附了OH之后，搭建了1.NO与OH吸附 2.NO2与OH吸附 3.NO吸附后与OH结合产生HNO2，4.NO2吸附后与OH结合产生HNO3的结构。在搭建 1，2这两种吸附结构的时候，NO总是会与OH中的O结合的较近，而且以优化后的吸附结构为基础搭建3，4结构，优化后的反应产物结构其体系的能量与吸附结构的体系能量几乎相同，彼此之间仅有-0.06eV左右的差距。请问是我结构搭建的时候存在问题吗？吸附结构中，我把初始距离拉大到了2.5埃以上为何还是不行呢。还请老师们指点一下，万分感谢。
吸附结构，反应结构的POSCAR和CONTCAR以及INCAR我都放在了附件里，麻烦老师们看一下。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-9-21 18:02:34

有可能表明，你的表面上NO或NO2和OH的反应是没有势垒的。
建议做个柔性扫描，如果证明确实没有势垒，文章里可以用扫描曲线做证据，然后reaction profile图不画这一步的反应物和过渡态

淼飍 · 发表于 Post on 2021-9-21 18:08:18

wzkchem5 发表于 2021-9-21 18:02
有可能表明，你的表面上NO或NO2和OH的反应是没有势垒的。
建议做个柔性扫描，如果证明确实没有势垒，文章 ...

感谢老师的回复，请问柔性扫描是需要Gaussian嘛？VASP可以做吗？顺祝老师中秋节快乐

sobereva · 发表于 Post on 2021-9-22 06:23:10

Gaussian用簇模型算这个体系的柔性扫描完全可以

淼飍 · 发表于 Post on 2021-9-24 17:52:16

sobereva 发表于 2021-9-22 06:23
Gaussian用簇模型算这个体系的柔性扫描完全可以

哦哦好的老师，我尝试一下，感谢

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[VASP] VASP计算Pd-C3N4表面吸附OH后与NO以及NO2反应结构的搭建求助

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