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[GROMACS] 求助气液界面表面张力计算,第三次计算成了负值的原因是什么

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楼主
老师,您好!我模拟的体系是甲烷/表面活性剂/水,根据您之前的公式,γ=(1/n)*Lz*<P_zz-(P_xx+P_yy)/2>,前两次模拟得到的界面张力还比较正常,第三次计算时表面张力就变成了负值,不知道出现这种问题的原因是什么,请老师指点一下!谢谢老师!

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发表于 Post on 2021-10-13 02:10:12 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“气液界面表面张力”改了,以后务必注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2021-10-13 02:11:46 | 只看该作者 Only view this author
说清楚具体情况,前两次结果都是多少,第三次是多少,每次跑的时候差异在哪(仅仅重复跑同一个trr还是怎么着),mdp怎么设的

并且注意看此文
数值误差对计算化学结果重现性的影响
http://sobereva.com/88
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发表于 Post on 2022-2-9 12:37:05 | 只看该作者 Only view this author
你好同学,请问一下相变面在盒子里是怎么处理的啊

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发表于 Post on 2026-1-14 13:08:17 | 只看该作者 Only view this author
同学你好我目前跑液液界面也遇到了这个问题,请问你是如何解决的

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