Rosetta中的常见问题汇总（持续更新）

shiyunfan

wendao 发表于 2023-7-10 13:23
报错很清楚就是打不开那个文件，我没看懂你到底是有那个文件还是没有，有的话需要检查路径或者权限哪里错 ...

谢谢，是我搞错了路径

TMULYU

Error: (0) [ ERROR ] ERROR: Exception caught by JobDistributor while trying to get pose from job 'A_crystal_0001'
Error: (0) [ ERROR ] Treating failure as bad input; canceling similar jobs

[ ERROR ]: Caught exception:


你好，在relax的时候出现再个错误是因为什么

Lyueyang2020

在使用【Cartesian_ddG】运行 cartesian_ddg.static.linuxgccrelease 时报错“ERROR: Scorefunction not set up for nonideal/Cartesian scoring”，命令行为“cartesian_ddg.static.linuxgccrelease -s ../lowest_energy.pdb -ddg:mut_file ../test1.mutfile -interface_ddg 1 -extra_res_fa ../LIG.params -score:extra_improper_file ../LIG.tors -optimization:default_max_cycles 20”。请求指教！！感谢

hanlan8702

Lyueyang2020 发表于 2024-6-27 12:15
在使用【Cartesian_ddG】运行 cartesian_ddg.static.linuxgccrelease 时报错“ERROR: Scorefunction not se ...

使用带cart的权重，如ref2015_cart，-score:weights ref2015_cart

hanlan8702

请问已经使用-ignore_zero_occupancy false，依旧还是报ERROR: Cannot compute center of mass of zero residues!这个错误。有什么方法解决吗？使用的是rosetta 371这个版本的程序，进行docking_prepack_protocol的时候出现这个错误。谢谢。