使用MolAICal 进行分子对接

BEICEHNG · 发表于 Post on 2022-6-21 11:38:57

你好，请问我这里怎么生成不了PDBQT文件呢？

MolAICal · 发表于 Post on 2022-7-2 16:38:12

本帖最后由 MolAICal 于 2022-7-2 16:39 编辑

BEICEHNG 发表于 2022-6-21 11:38
你好，请问我这里怎么生成不了PDBQT文件呢？

你把protein.pdb以附件的形式贴在回复贴里面。。我帮你看一下。或者加QQ群：1151656349 ，我在群里帮你看一下

XYT42 · 发表于 Post on 2023-7-16 22:39:20

本帖最后由 XYT42 于 2023-7-16 23:21 编辑

请问在windows系统下使用Cmder运行molaical.exe，为什么显示的是# Project leader: Qifeng Bai, the official site of MolAICal: https://molaical.github.io or https://molaical.gitee.io #（前提：已经在系统环境变量添加MolAICal的安装路径 D:\Linuxpackage\Docking\MolAICal-win64-v1.3）
该问题已解决：https://molaical.github.io/install.html

MolAICal · 发表于 Post on 2023-12-13 15:25:16

BEICEHNG 发表于 2022-6-21 11:38
**** 作者被禁止或删除内容自动屏蔽 ****

需要安装一下MolAICal，具体请见：https://molaical.github.io/install.html

nianbin · 发表于 Post on 2023-12-14 08:52:45

请问支持虚拟筛选吗？有小分子数据库吗？

MolAICal · 发表于 Post on 2023-12-14 15:58:53

nianbin 发表于 2023-12-14 08:52
请问支持虚拟筛选吗？有小分子数据库吗？

支持虚拟筛选，直接用ZINC数据库即可 https://zinc.docking.org/

xcgotk · 发表于 Post on 2026-6-17 16:21:09

您好，请问阴离子配体如何处理呢，我尝试用H和用钠离子，二者位点一致，但是能量差很多，钠离子更好，但是打开构象查看的时候看到的还是H

xcgotk · 发表于 Post on 2026-6-17 16:38:35

请问如何处理阴离子配体呢，我使用H和钠离子都做了，钠离子的能量更低，但是查看构像时候发现变成了H

xcgotk · 发表于 Post on 2026-6-17 16:40:18

请问如何处理阴离子配体呢，我使用H和钠离子都尝试了，钠离子能量更低，但是查看构象的时候发现又变回h了

xcgotk · 发表于 Post on 2026-6-17 16:43:03

本帖最后由 xcgotk 于 2026-6-17 16:45 编辑

实在不好意思，不是故意盖楼，我这边网络不好，发完提问我数次刷新都没有看到自己的提问导致我多次尝试，目前我刷新仍然看不到自己的提问，我选择仅查看自己的时候发现了那么多，烦请管理员删除，添麻烦实在不好意思

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[分子对接] 使用MolAICal 进行分子对接