求助：利用sob老师编写的Fortran代码计算原子电荷出现错误

zcw · 发表于 Post on 2021-11-4 15:43:20

本帖最后由 zcw 于 2021-11-4 16:12 编辑

读了sob老师的博文“将GROMACS的原子电荷信息读入VMD的方法”。我尝试利用sob老师的Fortran来计算电荷，可是显示有错误：Error in finding #molblock。
我也更改了代码中的nmol,可还是不行。想要知道该怎么解决。我使用的是gromacs-4.5.5版本。

snljty · 发表于 Post on 2021-11-4 15:52:13

Fortran写的不叫脚本。用解释器而不（直接）用编译器的才叫脚本。
不提供你的gromacs版本和测试文件，估计没法解决。毕竟卢老师肯定测过至少测试文件是没问题的。

zcw · 发表于 Post on 2021-11-4 16:13:31

snljty 发表于 2021-11-4 15:52
Fortran写的不叫脚本。用解释器而不（直接）用编译器的才叫脚本。
不提供你的gromacs版本和测试文件，估计 ...

好的，谢谢你的提醒，我用的是gromacs-4.5.5版本，测试文件太大上传不了。

sobereva · 发表于 Post on 2021-11-4 16:16:20

4.5.5那么老的版本兼容不了很正常，你得根据那个版本的gmxdump给出的信息修改程序，要么用较新的GROMACS版本，诸如2018

如果要求不高，直接用GROMACS产生pqr文件载入VMD也可以

zcw · 发表于 Post on 2021-11-4 16:27:10

sobereva 发表于 2021-11-4 16:16
4.5.5那么老的版本兼容不了很正常，你得根据那个版本的gmxdump给出的信息修改程序，要么用较新的GROMACS版 ...

好的，sob老师

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