为什么ELF投影图一样，而LOL和电子密度的拉普拉斯函数等值线图不一样，如图

ddddnight · 发表于 Post on 2021-11-19 22:59:46

本帖最后由 ddddnight 于 2021-11-20 14:51 编辑

我用multiwfn，按照手册上说的画了这三种图，但是加了电场和未加电场的ELF投影图一样，而其他两种不一样，这是为什么呢？选择的都是X=0的YZ平面。

sobereva · 发表于 Post on 2021-11-20 08:11:34

那叫电子密度的拉普拉斯函数，不叫拉普拉斯算子。拉普拉斯算子只是▽^2这个算符本身而已，根本不是一种实空间函数。

我都看不明白你画的是什么东西，什么体系、电场怎么加的、加的多大。把图片整理好，弄成类似报告的ppt那样标注清楚再贴，参考比如下文的图

一篇文章深入揭示外电场对18碳环的超强调控作用
http://sobereva.com/570（http://bbs.keinsci.com/thread-19364-1-1.html）

ddddnight · 发表于 Post on 2021-11-20 14:52:15

sobereva 发表于 2021-11-20 08:11
那叫电子密度的拉普拉斯函数，不叫拉普拉斯算子。拉普拉斯算子只是▽^2这个算符本身而已，根本不是一种实空 ...

老师，我重新编辑了，您看一下

sobereva · 发表于 Post on 2021-11-20 15:26:53

如果你作图步骤相同，加电场和没加电场时候肯定对应的坐标严重不符，要不然不可能加电场的时候电子密度拉普拉斯函数图没有任何原子在图上

如果你加电场时用了nosymm，没加的时候没写nosymm，而且输入文件里的坐标又不在标准朝向下，势必导致得到的fch文件里原子坐标不对应。注意看此文
谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用
http://sobereva.com/297（http://bbs.keinsci.com/thread-1355-1-1.html）

ddddnight · 发表于 Post on 2021-11-20 16:40:32

sobereva 发表于 2021-11-20 15:26
如果你作图步骤相同，加电场和没加电场时候肯定对应的坐标严重不符，要不然不可能加电场的时候电子密度拉普 ...

作图步骤和手册中4.4一样。确实没有电场作用的情况下没有用nosymm指令，加电场的指令用的field=read，然后再输入文件末尾加上电场的大小指令。是不是加上nosymm重新对结构进行优化就可以了。如果加上nosymm的话，会不会两个图都没有原子在图上了，就和图中加了电场的情况一样。

sobereva · 发表于 Post on 2021-11-21 06:34:54

ddddnight 发表于 2021-11-20 16:40
作图步骤和手册中4.4一样。确实没有电场作用的情况下没有用nosymm指令，加电场的指令用的field=read，然 ...

你在Multiwfn的主功能0看一眼结构，当前分子的位置和朝向是什么样立马就知道。选择作图平面的时候必须结合含有坐标轴的三维结构图判断怎么选择恰当的作图平面。

原子在不在图上，明显取决于当前体系朝向/位置、怎么选的作图平面。结合实际结构图和基本逻辑判断。

nosymm会产生什么影响我前面的博文已经写得极为清楚了。

ddddnight · 发表于 Post on 2021-11-21 11:16:43

sobereva 发表于 2021-11-21 06:34
你在Multiwfn的主功能0看一眼结构，当前分子的位置和朝向是什么样立马就知道。选择作图平面的时候必须结 ...

好的，谢谢老师

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