GROMACS里面plumed插件计算自由能相关问题

yjw1204338757 · 发表于 Post on 2021-12-3 09:58:12

用GROMACS里面带的plumed插件计算自由能过程中，普通元动力学计算用sum_hills命令计算的自由能，那用well-tempered metadynamics计算时，是否还需要用sum_hills命令计算自由能呢？在网上看到一篇博文说用well-tempered metadynamics计算HILLS文件里面的是负的自由能。

Daniel_Arndt · 发表于 Post on 2021-12-4 09:58:19

这些问题在plumed官网的教程中都涉及了，只需要学会搜索引擎中在站内搜索的语法site就行了。

https://www.plumed.org/doc-v2.7/ ... sterclass-21-4.html

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[GROMACS] GROMACS里面plumed插件计算自由能相关问题