计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 5688|回复 Reply: 53

[其它] 批评两篇用了Multiwfn却只字不提的文章:Chem Eng Sci (2022)、J Hazard Mater (2021)

  [复制链接 Copy URL]

3万

帖子

99

威望

4万

eV
积分
81661

管理员

公社社长+计算化学玩家

发表于 Post on 2021-12-9 10:27:03 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
今天同一天就偶然发现新发表的两篇用了Multiwfn却只字不提的文章,可想而知这种文章还有多少。我实在忍不住点名批评一下。这种事实在非常常见,这两篇作为典型例子,在此严厉谴责,点名批评。借这个机会特此强调:不要把引用Multiwfn不当回事!


2021-Dec-11补充: 下面这篇文章作者之一在本帖25L给了回复,是其疏忽所致,不属于故意行为。
第一篇Chemical Engineering Science 249 (2022) 117317
Combinatorial screening of ionic liquid extractant for removal of methanol from methylal
https://doi.org/10.1016/j.ces.2021.117317

1.png

用Multiwfn做了静电势和IGM分析,明显是按照我下面两篇博文做的
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html
通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用
http://sobereva.com/407http://bbs.keinsci.com/thread-9472-1-1.html

文章却对Multiwfn却只字不提,对Multiwfn官网下载页面、程序手册、程序启动时明确提示要求引用的Multiwfn原文完全不引用

1.jpg

2.jpg



第二篇
https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0304389421027217
Journal of Hazardous Materials (2022) DOI: 10.1016/j.jhazmat.2021.127752
Amphiphilic small molecular mates match hydrophobic drugs to form nanoassemblies based on drug-mate strategy

Clipboard01.png

此文也用Multiwfn做了IGM分析,即下图最上面三个;还用Multiwfn做了AIM拓扑分析,下图中间三个,做法见《使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)》(http://sobereva.com/445

x2.jpg

此文还按照《用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法(含演示视频)》(http://sobereva.com/449)用Multiwfn结合VMD绘制了分子轨道图,右边那一列

x.jpg

然而此文也是对Multiwfn只字不提,原文也不引用!


在批评这两篇文章作者的同时,同时提醒缺乏引用常识者应阅读
写计算化学文章时引用理论方法、基组、程序时应注意的问题
http://sobereva.com/370http://bbs.keinsci.com/thread-5593-1-1.html



评分 Rate

参与人数
Participants 14
eV +65 收起 理由
Reason
the_phantom + 4 正解
勘察加拟石蟹 + 4 我很赞同
yihanxu + 5 我很赞同
柳二三 + 3 我很赞同
xxtnenu + 4 我很赞同
heheda + 5 我很赞同
阿di达思 + 5 我很赞同
Little-Extra + 5 我很赞同
ChrisZheng + 5 正解
ezez + 5 赞!
Icestone + 5 我很赞同
wypkdhd + 5 不引就很过分那种
Kangtor + 5 我很赞同
函数与激情 + 5 支持

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班。这些培训是计算化学快速入门以及全面系统性提升研究水平的最佳途径,培训各种相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

26

帖子

0

威望

154

eV
积分
180

Level 3 能力者

发表于 Post on 2021-12-9 10:47:25 | 显示全部楼层 Show all
严厉谴责 卢老师辛苦了

3万

帖子

99

威望

4万

eV
积分
81661

管理员

公社社长+计算化学玩家

 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-9 10:50:22 | 显示全部楼层 Show all
现在一些用户也太不像话了

再顺带一说,不当引用molclus的现象也极其严重。最近六篇用了molclus的文章里四篇都没有按官网上的要求引用,恰当引用有那么难么???
所有不按照要求正确引用molclus的我全都在程序主页http://www.keinsci.com/research/molclus.html上做了标记予以公示。

Clipboard01.png
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班。这些培训是计算化学快速入门以及全面系统性提升研究水平的最佳途径,培训各种相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

26

帖子

0

威望

154

eV
积分
180

Level 3 能力者

发表于 Post on 2021-12-9 10:58:16 | 显示全部楼层 Show all
第二篇还是中科院+交大+UCLA的通讯单位。。

92

帖子

1

威望

1083

eV
积分
1195

Level 4 (黑子)

发表于 Post on 2021-12-9 11:00:21 | 显示全部楼层 Show all
哪怕不看计算方法就知道是用了Multiwfn,这是真白嫖啊!必须谴责
我唯一知道的就是我一无所知,但我是化学小迷弟

45

帖子

0

威望

431

eV
积分
476

Level 3 能力者

发表于 Post on 2021-12-9 11:05:42 | 显示全部楼层 Show all
还都是中国人的文章,羞啊!

3万

帖子

99

威望

4万

eV
积分
81661

管理员

公社社长+计算化学玩家

 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-9 11:09:13 | 显示全部楼层 Show all
Marc0 发表于 2021-12-9 11:05
还都是中国人的文章,羞啊!

根据我统计的8000多篇引用Multiwfn的文章,不按要求引用Multiwfn的文章里就数中国人的文章最多(不是总数,而是指比率),其次是一些第三世界国家的。而欧美研究者绝大多数都能恰当引用Multiwfn。

我真是怎么强调都没用,甚至都已经明确在下载页面用红字高亮了。国人胡引瞎引问题始终严重,像本帖这样根本都只字不提的文章还不知道有多少。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班。这些培训是计算化学快速入门以及全面系统性提升研究水平的最佳途径,培训各种相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

9

帖子

0

威望

333

eV
积分
342

Level 3 能力者

发表于 Post on 2021-12-9 11:12:53 | 显示全部楼层 Show all
平时看到文章里分子结构的那个配色,一看就是Multiwfn里直接导出来的,不引用就搞不懂是什么心态。

3万

帖子

99

威望

4万

eV
积分
81661

管理员

公社社长+计算化学玩家

 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-9 11:15:47 | 显示全部楼层 Show all
再顺带一说,在Multiwfn主页的Download页面都写得如此明白了,用红字高亮了,甚至还用中文写了,奉劝某些用户别假装看不见。用Multiwfn发文章,不是主观想不想引用的事,而是强制引用,这在使用许可(License)里已经明确写明了,是法律层面的事。不按照使用许可使用程序,和使用盗版都没有什么两样,我有权向和出版社交涉要求撤稿。

Clipboard01.png
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班。这些培训是计算化学快速入门以及全面系统性提升研究水平的最佳途径,培训各种相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

84

帖子

0

威望

1509

eV
积分
1593

Level 5 (御坂)

发表于 Post on 2021-12-9 11:30:01 | 显示全部楼层 Show all
老板也让我审过一些文章,sob说的这种情况确实太常见了。甚至之前我跟老板说,要作者把文章引上,结果到了文章见刊后,发现还是没引。这种现象确实太普遍了,而且目测很多人压根是故意不想引用,而不是不会引用。

3万

帖子

99

威望

4万

eV
积分
81661

管理员

公社社长+计算化学玩家

 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-9 11:35:05 | 显示全部楼层 Show all
GoldenBaby 发表于 2021-12-9 11:30
老板也让我审过一些文章,sob说的这种情况确实太常见了。甚至之前我跟老板说,要作者把文章引上,结果到了 ...

我也这么觉得

每次我审稿,看到有人对基组、泛函等明显该引用却不引用的情况,我一律会要求作者引用,这是一个合格的审稿人应尽的义务。而且编辑也应当在文章引用上把关,不能纵容一些作者胡来。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班。这些培训是计算化学快速入门以及全面系统性提升研究水平的最佳途径,培训各种相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

95

帖子

3

威望

2966

eV
积分
3121

Level 5 (御坂)

发表于 Post on 2021-12-9 11:55:55 | 显示全部楼层 Show all
审过AOM的论文,明显用了Multiwfn但是没有引用,审稿意见要求正确引用。
另外我也见过CEJ的上论文连计算软件都不说,直接蹦出一个数据,赶紧莫名奇妙的

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
sobereva + 2 谢谢

查看全部评分 View all ratings

45

帖子

0

威望

431

eV
积分
476

Level 3 能力者

发表于 Post on 2021-12-9 11:59:31 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2021-12-9 11:09
根据我统计的8000多篇引用Multiwfn的文章,不按要求引用Multiwfn的文章里就数中国人的文章最多(不是总数 ...

哎,真不知道该说什么好了。

1514

帖子

1

威望

3408

eV
积分
4942

Level 6 (一方通行)

发表于 Post on 2021-12-9 13:23:33 | 显示全部楼层 Show all
长期使用盗版软件的人,
你还能指望TA能正确的提到用的工具?

最基本的开源运作模式就是,
我的东西你随便用,
但是麻烦你,一定声明一下,
你用的谁写的代码……这相当于引用。
如有修改,请务必说明改了啥?
这相当于相关工作的评述和自己工作是否有必要。

你看看,有多少白嫖开源资源的,
还说是自主知识产权的!

身边,到处都是,是不是很常见!
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
App,  https://gitee.com/hpc4you/linux
hpc4you toolkit,  https://gitee.com/hpc4you/hpc
电邮hpc4you@163.com VX: hpc4you

969

帖子

0

威望

2985

eV
积分
3954

Level 5 (御坂)

发表于 Post on 2021-12-9 14:16:34 来自手机 | 显示全部楼层 Show all
这里说用处不大吧。 应该直接给通讯作者去信

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )

GMT+8, 2022-5-22 19:16 , Processed in 0.471123 second(s), 28 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list