计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9716|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] ALIE分析问题

[复制链接 Copy URL]

538

帖子

2

威望

2482

eV
积分
3060

Level 5 (御坂)

老师:您好!根据您这里的幻灯片[img]file:///C:\Users\T\AppData\Roaming\Tencent\Users\332734832\QQ\WinTemp\RichOle\93K]]6~VNL)I%UN0K5~R[OI.png[/img],ALIE是只能预测亲电位点,但是我们输出时还有这样一个输出形式file:///C:/Users/T/AppData/Roaming/Tencent/Users/332734832/QQ/WinTemp/RichOle/Y2%25TXYMHBH)TZ2L6H13(_RQ.png,我们是否就只需看红色方框中的数值,如果是这样请问此处输出的file:///C:/Users/T/AppData/Roaming/Tencent/Users/332734832/QQ/WinTemp/RichOle/P27G0XZL(TB9P%7DX9FJS4%60$K.png在分析ALIE又有什么用呢?谢谢!

输出形式.png (34.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 42)

输出形式.png

这样一个输出形式.png (2.1 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

这样一个输出形式.png

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120081

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2016-2-27 17:03:13 | 只看该作者 Only view this author
ALIE的极大点物理意义上是指电子最难电离的地方,但是从化学上来说没什么用。
Multiwfn定量分子表面分析功能不管对于哪个实空间函数,都会输出表面极大点和极小点。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

538

帖子

2

威望

2482

eV
积分
3060

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-27 17:16:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-2-27 17:03
ALIE的极大点物理意义上是指电子最难电离的地方,但是从化学上来说没什么用。
Multiwfn定量分子表面分析功 ...

恩,好的 谢谢老师!在您的幻灯片中,您说原子越靠近vdW上最小的ESP点,表示越容易发生亲电反应,可是最近的体系是个较复杂的三维体系,请问有什么技巧更加的容易的看是否是靠近呢?谢谢!

QQ图片20150209171820.png (114.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

QQ图片20150209171820.png

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120081

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2016-2-27 17:23:24 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2016-2-27 17:16
恩,好的 谢谢老师!在您的幻灯片中,您说原子越靠近vdW上最小的ESP点,表示越容易发生亲电反应,可是最 ...

三维也是一样,看图上那个表面ESP最小点的位置在哪个原子附近。
如果在Multiwfn里不好旋转视角,可以用类似此文的方法在VMD里显示:
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布
http://sobereva.com/196
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

538

帖子

2

威望

2482

eV
积分
3060

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-27 17:24:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-2-27 17:23
三维也是一样,看图上那个表面ESP最小点的位置在哪个原子附近。
如果在Multiwfn里不好旋转视角,可以用 ...

恩  ,好的 谢谢老师!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-13 05:30 , Processed in 0.201854 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list