求助 AutoDock 无法载入蛋白分子

crush · 发表于 Post on 2022-1-25 19:12:31

请问各位，为什么我的蛋白用H++在线程序处理过后无法加载到AutoDock中呢？

tomwong4253 · 发表于 Post on 2022-1-28 15:52:22

PDB格式坏了，有些什么在线处理程序，没有严格自己的输出，很容易破坏PDB固有的格式。PDB第几列到第几列是空格，第几列到第几列是坐标，都有严格规定的，不是XJB空几格都行的。你可以找个完好的PDB文件去对应一下，每一列每一列确认清楚，再用autodock等软件去读取就行了。

crush · 发表于 Post on 2022-1-29 17:25:20

tomwong4253 发表于 2022-1-28 15:52
PDB格式坏了，有些什么在线处理程序，没有严格自己的输出，很容易破坏PDB固有的格式。PDB第几列到第几列是 ...

好的好的，非常感谢您的解答！

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[分子对接] 求助 AutoDock 无法载入蛋白分子