跑QE结构优化如何让CPU满负载运行

yzy1995123 · 发表于 Post on 2022-2-14 22:58:12

各位老师好，我用QE跑结构优化，感觉速度很慢，不知道是不是体系的问题，然后看CPU运行只有70-80%，这个应该怎么解决呢，电脑配置是32核双路，输入的时候是mpirun -np 64 pw.x 感觉好像没问题，请问如何让cpu满负荷运行。

sobereva · 发表于 Post on 2022-2-15 06:49:29

有多少物理核心-np后面最多写多少，32核写64干嘛

yzy1995123 · 发表于 Post on 2022-2-15 10:06:09

sobereva 发表于 2022-2-15 06:49
有多少物理核心-np后面最多写多少，32核写64干嘛

老师您好，因为是32核64线程*2所以写了64核

Eudaimonia · 发表于 Post on 2022-2-15 10:28:47

yzy1995123 发表于 2022-2-15 10:06
老师您好，因为是32核64线程*2所以写了64核

按我之前对cp2k的测试，这么设置是没有用的，我猜QE应该也一样；

机子是36核，使用-np 36时cpu占用率50，使用-np 72直接报错；再增加一个任务也使用-np 36时，此时cpu占用率为100，但是两个任务每个SCF迭代速率大致都是原来的50%；

可以了解一下超线程这玩意究竟是干什么的；简单的说，大致是为了让你电脑核心被占满时，还能继续使用一些低负载的功能，而不是卡死的技术；

yzy1995123 · 发表于 Post on 2022-2-15 10:31:51

Eudaimonia 发表于 2022-2-15 10:28
按我之前对cp2k的测试，这么设置是没有用的，我猜QE应该也一样；

机子是36核，使用-np 36时cpu占用率5 ...

我也尝试了两个任务写-np 64,但是CPU占用率还是80%左右。而且这个运算任务我之前跑过，大概四五个小时就能结束，这次跑了十多个小时还没有结果，所以不知道是咋回事

snljty · 发表于 Post on 2022-2-15 11:15:43

yzy1995123 发表于 2022-2-15 10:31
我也尝试了两个任务写-np 64,但是CPU占用率还是80%左右。而且这个运算任务我之前跑过，大概四五个小时就 ...

你对top命令显示的CPU占用率和超线程有误解，看《正确认识超线程(HT)技术对计算化学运算的影响》http://sobereva.com/392

yzy1995123 · 发表于 Post on 2022-2-15 13:55:53

snljty 发表于 2022-2-15 11:15
你对top命令显示的CPU占用率和超线程有误解，看《正确认识超线程(HT)技术对计算化学运算的影响》http://s ...

好的，感谢老师

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