计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 24423|回复 Reply: 17

[VMD] 在VMD里使用环境光遮蔽改进渲染效果

[复制链接 Copy URL]

4万

帖子

99

威望

4万

eV
积分
89946

管理员

公社社长+计算化学玩家

发表于 Post on 2014-11-17 08:27:33 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
在VMD里使用环境光遮蔽改进渲染效果

文/Sobereva @北京科音   2014-Nov-17

在较新版本的VMD里,可以使用ambient occlusion(AO,环境光遮蔽)来改进自带的Tachyon渲染器的渲染效果。这可以使体系在光线照射下呈现的阴暗区域柔和、自然地表现出来,丝毫不逊色于用povray渲染,甚至看着更舒服一些。

开启AO的做法很简单,在display setting里面把Shadows和Amb. Occl.打开,把Drawing method设为那种物体占的体积比较大的显示方式,比如VDW方式,材质设定为AO开头的比如AOEdgy。然后file-render,选择用内建的Tachyon渲染就行了。开了这两项之后会令Tachyon渲染耗时增加很多。

这幅图是直接用tachyon渲染的磷脂膜,看不出明暗,缺乏层次感
mem.jpg

下面这是用上述方法开启AO后渲染的,层次清晰,也柔和多了
mem_AO.jpg


再看一个例子,这是病毒颗粒,用的是quicksurf方式来快速显示体系的表面,用radial方式着色(越靠外越红)。选择方式输入all not (z>20 and x>20 and y>20)来给体系开了个小口。

下图是没开AO时渲染的,病毒颗粒里面全都能看到
capsid.jpg

下面是开了AO渲染的,只有冲着开口的那一块内侧区域被光线照射才显露出来。颗粒外部区域看起来柔和多了,轮廓更为清楚。
capsid_AO.jpg

在display setting里可以对Shadows和Amb. Occl.的程度进行调节,在graphics-material里可以再对材质特征进行调节。

评分 Rate

参与人数
Participants 2
eV +8 收起 理由
Reason
klklklzzd + 4 谢谢分享
liyuanhe211 + 4 牛!

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的最佳途径。培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

92

帖子

0

威望

4643

eV
积分
4735

Level 6 (一方通行)

发表于 Post on 2014-11-17 09:23:56 | 显示全部楼层 Show all
:):):)
树欲静而风不止

295

帖子

0

威望

3520

eV
积分
3815

Level 5 (御坂)

发表于 Post on 2014-11-17 12:05:07 | 显示全部楼层 Show all
试了一下,感觉效果不错!顶

595

帖子

11

威望

9383

eV
积分
10198

Level 6 (一方通行)

发表于 Post on 2014-11-17 20:28:19 | 显示全部楼层 Show all
很好看!
计算化学与分子模拟

3

帖子

0

威望

20

eV
积分
23

Level 1 能力者

发表于 Post on 2014-11-19 16:39:54 | 显示全部楼层 Show all
很漂亮 啊

12

帖子

0

威望

632

eV
积分
644

Level 4 (黑子)

发表于 Post on 2014-11-19 23:27:56 | 显示全部楼层 Show all
怎么感觉病毒那个图不开渲染还好看点
做一个有理想的阳光少年\( ^▽^ )/

146

帖子

0

威望

2728

eV
积分
2874

Level 5 (御坂)

发表于 Post on 2014-11-27 16:38:53 | 显示全部楼层 Show all
开AO渲染是必须的,再加上点儿Hue,就很漂亮了。有些时候可以再把透明材质加进去,不过渲染时间就长了很多。不知道Tachyon啥时候能支持GPU加速,支持了就很爽了。

4万

帖子

99

威望

4万

eV
积分
89946

管理员

公社社长+计算化学玩家

 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-11-27 17:37:56 | 显示全部楼层 Show all
yjmaxpayne 发表于 2014-11-27 16:38
开AO渲染是必须的,再加上点儿Hue,就很漂亮了。有些时候可以再把透明材质加进去,不过渲染时间就长了很多 ...

1.9.2据说有了GPU版tachyon,不过试了下1.9.2beta,并没发现任何加速效果
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的最佳途径。培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

146

帖子

0

威望

2728

eV
积分
2874

Level 5 (御坂)

发表于 Post on 2014-11-28 13:22:42 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2014-11-27 17:37
1.9.2据说有了GPU版tachyon,不过试了下1.9.2beta,并没发现任何加速效果

我用的就是win版最新的beta,但是确实好像没有啥效果。 linux版的没有条件试试。 估计最近出的版本难说可以。

146

帖子

0

威望

2728

eV
积分
2874

Level 5 (御坂)

发表于 Post on 2014-11-28 13:36:54 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2014-11-27 17:37
1.9.2据说有了GPU版tachyon,不过试了下1.9.2beta,并没发现任何加速效果

Sob下载的是这个版本么?

VMD 1.9.2 Interactive GPU Ray Tracing

Download: VMD 1.9.2 w/ TachyonL-OptiX (Requires NVIDIA driver series 340 or later, 343 for Maxwell GPUs!!!)

http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/vmd-new/optix.html

看起来各种牛逼啊,尤其喜欢这张图:

4万

帖子

99

威望

4万

eV
积分
89946

管理员

公社社长+计算化学玩家

 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-11-28 20:09:47 | 显示全部楼层 Show all
yjmaxpayne 发表于 2014-11-28 13:36
Sob下载的是这个版本么?

VMD 1.9.2 Interactive GPU Ray Tracing

不是,是download页面里的标准1.9.2beta版,可能其中还没把这个包含进去。等正式版出了再折腾。

这张图就是景深太浅了,有点滥用大光圈...
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的最佳途径。培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

121

帖子

0

威望

2696

eV
积分
2817

Level 5 (御坂)

发表于 Post on 2014-11-29 00:52:10 | 显示全部楼层 Show all
看着立体感十足

31

帖子

0

威望

244

eV
积分
275

Level 3 能力者

发表于 Post on 2015-2-5 17:25:18 | 显示全部楼层 Show all
学习了谢谢
I am freeman.....

41

帖子

0

威望

949

eV
积分
990

Level 4 (黑子)

发表于 Post on 2015-6-12 09:22:45 | 显示全部楼层 Show all
这里有一个不错的教程:
《Rendering with Tachyon》
http://bionano.physics.illinois.edu/tutorials/rendering-tachyon

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
sobereva + 3

查看全部评分 View all ratings

39

帖子

0

威望

1622

eV
积分
1661

Level 5 (御坂)

发表于 Post on 2020-4-4 11:50:43 | 显示全部楼层 Show all
请问这种渲染方法,速度跟GPU有关还是CPU有关?现在的电脑感觉渲染一张图很慢,不知应该换个显卡还是换个CPU

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2023-2-6 03:36 , Processed in 0.258040 second(s), 31 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list