计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 31126|回复 Reply: 25
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 能否详细讲解下CCSD(t)优化的使用注意事项以及技巧?

[复制链接 Copy URL]

66

帖子

0

威望

297

eV
积分
363

Level 3 能力者

本帖最后由 mmjjmmjj 于 2016-3-10 19:36 编辑

哪位大侠能否详细讲解下CCSD(T)优化的使用注意事项以及技巧呢?会用,但是感觉使用并不是很得当。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125156

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2016-3-10 17:08:27 | 只看该作者 Only view this author
要写成CCSD(T),T大写。
甭用它来优化,CCSD对于优化目的已经足够,CCSD(T)主要是用来算单点的。绝大多数程序里CCSD(T)都没有解析梯度,故只能用有限差分计算梯度,再加上其单点计算量很大,所以也就能优化几个原子的体系。而且Gaussian里用它优化你还得把被优化的几何变量用变量方式表达,麻烦。另外,几何结构对于计算级别敏感度较低,从优化结果上一般很难看出CCSD和CCSD(T)的差异。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

66

帖子

0

威望

297

eV
积分
363

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-10 19:25:09 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mmjjmmjj 于 2016-3-10 20:00 编辑

哦。您这个太有用了!就是说1. 比较优化后的能量时用CCSD,如果是比较单点再用CCSD(T)处理?
2. 高斯里面算CCSD(T)中给出的CCSD的结果是否等于用CCSD算的结果?3. 用CCSD(T)优化,如何表明优化哪些量?如果没有标明,会有什么后果呢?

谢谢大神!

66

帖子

0

威望

297

eV
积分
363

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-10 19:28:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mmjjmmjj 于 2016-3-10 19:39 编辑
sobereva 发表于 2016-3-10 17:08
要写成CCSD(T),T大写。
甭用它来优化,CCSD对于优化目的已经足够,CCSD(T)主要是用来算单点的。绝大多数 ...

另外,最近发表拙作一篇,在文章中应用了Multiwfn。确实非常好用实在的软件!

66

帖子

0

威望

297

eV
积分
363

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-10 19:35:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-10 17:08
要写成CCSD(T),T大写。
甭用它来优化,CCSD对于优化目的已经足够,CCSD(T)主要是用来算单点的。绝大多数 ...

另,您能否在思想家公社的门口撰写一点关于CCSD系列的帖子?相信会有很多人收益的!

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125156

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2016-3-11 06:14:05 | 只看该作者 Only view this author
mmjjmmjj 发表于 2016-3-10 19:25
哦。您这个太有用了!就是说1. 比较优化后的能量时用CCSD,如果是比较单点再用CCSD(T)处理?
2. 高斯里面 ...

1 没有所谓的“比较优化后的能量”。你要精确比较两个结构的能量,就先CCSD优化结构,然后CCSD(T)算单点比较能量。
2 等于
3

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
muuu2333 + 1

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125156

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2016-3-11 06:15:24 | 只看该作者 Only view this author
mmjjmmjj 发表于 2016-3-10 19:35
另,您能否在思想家公社的门口撰写一点关于CCSD系列的帖子?相信会有很多人收益的!

这没有什么好写的,基础理论在所有外文经典量化书里都有,你要想了解更多可以看
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

66

帖子

0

威望

297

eV
积分
363

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-11 16:12:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-11 06:14
1 没有所谓的“比较优化后的能量”。你要精确比较两个结构的能量,就先CCSD优化结构,然后CCSD(T)算单点 ...

比较能量时,如果已经用CCSD算出了结果,为什么还要用CCSD(T)再算一遍单点比较呢?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125156

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2016-3-11 16:41:26 | 只看该作者 Only view this author
mmjjmmjj 发表于 2016-3-11 16:12
比较能量时,如果已经用CCSD算出了结果,为什么还要用CCSD(T)再算一遍单点比较呢?

CCSD(T)的能量明显比CCSD准啊
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

442

帖子

0

威望

1500

eV
积分
1942

Level 5 (御坂)

10#
发表于 Post on 2016-3-27 17:17:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-11 16:41
CCSD(T)的能量明显比CCSD准啊

请教一下UCCSD(T)计算的结果已经经过零点能矫正了吗?为什么在单点计算的输出结果里看不到零点能矫正的信息?
另请教个位数原子用ccsd优化时,频率确认怎么做呢?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125156

管理员

公社社长

11#
发表于 Post on 2016-4-3 13:48:02 | 只看该作者 Only view this author
413 发表于 2016-3-27 17:17
请教一下UCCSD(T)计算的结果已经经过零点能矫正了吗?为什么在单点计算的输出结果里看不到零点能矫正的信 ...

直接计算的是单点能,没有ZPE。你得做freq才能得到ZPE。
单个原子频率计算和分子体系一样,但你没必要做什么频率确认,因为单个原子没有振动,只有平动
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

442

帖子

0

威望

1500

eV
积分
1942

Level 5 (御坂)

12#
发表于 Post on 2016-4-3 14:23:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-4-3 13:48
直接计算的是单点能,没有ZPE。你得做freq才能得到ZPE。
单个原子频率计算和分子体系一样,但你没必要做 ...

请教您一下,fchk文件中Total SCF Density指的是什么?下行输出会有三个相同的数值分别有什么意义呢?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125156

管理员

公社社长

13#
发表于 Post on 2016-4-3 14:35:47 | 只看该作者 Only view this author
413 发表于 2016-4-3 14:23
请教您一下,fchk文件中Total SCF Density指的是什么?下行输出会有三个相同的数值分别有什么意义呢?

对于CCSD(T),这就是HF的密度矩阵
不知道你说的哪三个数值
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

442

帖子

0

威望

1500

eV
积分
1942

Level 5 (御坂)

14#
发表于 Post on 2016-4-3 14:51:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-4-3 14:35
对于CCSD(T),这就是HF的密度矩阵
不知道你说的哪三个数值

抱歉, 我没表述清楚。
请教该矩阵的矩阵元个数与gaussian type primitive orbital有关系吗?
或该矩阵元个数怎么得来的呢?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125156

管理员

公社社长

15#
发表于 Post on 2016-4-3 14:58:52 | 只看该作者 Only view this author
413 发表于 2016-4-3 14:51
抱歉, 我没表述清楚。
请教该矩阵的矩阵元个数与gaussian type primitive orbital有关系吗?
或该矩阵 ...

密度矩阵的唯独是nbasis*nbasis,这里nbasis是指基函数数目。
由于是对称矩阵,所以fch里只记录下三角部分。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 00:45 , Processed in 1.060995 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list