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[新手求助] 求助得到紫外光谱的FWHM计算

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各位老师好,本人最近在计算分子的FWHM,将S1做垂直发射的log文件拖入gaussview中。点击UV-Vis,想要得到紫外光谱数据,在这里遇到一个问题:gauussview里紫外有一个展宽设置,展宽设置将会影响计算的FWHM,曾看过一篇段炼老师课题组的文章这里设置的是300cm-1,想问下各位老师这里展宽的设置有什么要求?大家都是怎么设置的呢?又或者说各位老师都是怎么计算发光光谱的FWHM的呢?本人新手一个,请各位老师多多指教~

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展宽的设置区域

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发表于 Post on 2022-3-18 18:41:47 | 只看该作者 Only view this author
这个窗口是在你已经知道FWHM(或者对FWHM有粗略估计,比如从类似化合物的实验FWHM来估计),计算了峰位置,想画出峰形的时候用的。不能用于你不知道FWHM的情形。
计算FWHM需要做振动分辨光谱(http://sobereva.com/223)或者热平均光谱(doi: 10.1063/1.4959605,图10)计算,单在S1平衡位置做一个普通垂直发射计算是不够的。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2022-3-18 18:41:53 | 只看该作者 Only view this author
FWHM还能计算的?

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发表于 Post on 2022-3-19 06:38:52 | 只看该作者 Only view this author
FWHM该怎么设此文都说了
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http://sobereva.com/224

FWHM不是算出来的,而是你自己指定的。如果有实验光谱,可以自行反复调节使得模拟的光谱与实验峰形整体最接近;如果没有,就用Multiwfn、GaussView等程序默认的FWHM。
对于溶液环境中的UV-Vis光谱,而且不特意考虑振动耦合的情况,Multiwfn默认的FWHM=2/3 eV通常就是适合的。
最合适的FWHM和被计算的体系、所处环境等因素都有关系。


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发表于 Post on 2022-3-19 18:02:13 | 只看该作者 Only view this author

算个振动分辨光谱,或者跑个动力学然后算热平均的光谱,然后从图上面量出FWHM就行了。只不过这种计算的主要结果是光谱,FWHM只是一个不重要的副产品而已
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-20 19:49:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-19 06:38
FWHM该怎么设此文都说了
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http://sobereva.com ...

好的,谢谢老师,我再去学习一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-20 19:53:58 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-3-19 18:02
算个振动分辨光谱,或者跑个动力学然后算热平均的光谱,然后从图上面量出FWHM就行了。只不过这种计算的主 ...

老师是这样的,因为我做的是一个MR-TADF分子,所以想要预测下半峰宽(就是取发射波长位置的峰值除以2,邻近左右找到两个数值,相减来预测FWHM),但是这里就涉及到GaussView这个展宽的问题

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发表于 Post on 2022-3-20 20:49:57 | 只看该作者 Only view this author
静静子 发表于 2022-3-20 12:53
老师是这样的,因为我做的是一个MR-TADF分子,所以想要预测下半峰宽(就是取发射波长位置的峰值除以2,邻 ...

那就像我说的,算一个振动分辨光谱或者热平均光谱,然后从光谱上面量半峰宽。
大部分人因为不在乎半峰宽,所以他们画光谱的流程是先粗估一个半峰宽,再用GaussView这个窗口结合峰值位置的数据来画发射谱图。所以你查到的资料都会假设你也是这么做的。但是你不一样,你要求的是半峰宽本身,所以必须用那些不需要知道半峰宽就能画出谱图的(比较复杂的)方法先画出图,再反过来从这个谱里面量出半峰宽,也就是你的工作流程和大部分人是相反的。GaussView这个窗口只能适用于正向的工作流程,也就是已知FWHM和峰位置画发射谱,而你需要的是已知发射谱求出FWHM和峰位置,所以你用GaussView这个窗口就是完全把已知数和未知数搞颠倒了,它叫你输入的已知数对你而言其实是你要求的未知数,那当然没法用。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-22 19:57:59 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-3-20 20:49
那就像我说的,算一个振动分辨光谱或者热平均光谱,然后从光谱上面量半峰宽。
大部分人因为不在乎半峰宽 ...

好的,谢谢老师指教

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发表于 Post on 2024-4-13 22:37:23 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-3-18 18:41
这个窗口是在你已经知道FWHM(或者对FWHM有粗略估计,比如从类似化合物的实验FWHM来估计),计算了峰位置, ...

老师,我最近在算振动分辨的光谱,虽然做出来了,但是我发现只要一直改变输入文件里设置的SpecHwHm(半峰半宽)总有一个波形能跟实验对的上其实所以我不太能理解文章里作者常写的FWHM与实验值很接近证明几何结构优化的很合理这句话...

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发表于 Post on 2024-4-14 15:54:04 | 只看该作者 Only view this author
天天121 发表于 2024-4-13 15:37
老师,我最近在算振动分辨的光谱,虽然做出来了,但是我发现只要一直改变输入文件里设置的SpecHwHm(半峰 ...

这个说明,对于你的所有体系而言,计算的振动展宽都小于实验的总展宽,所以调整SpecHwHm(也就是增加自然展宽和溶剂展宽)总能让总展宽和实验相符。
但是假如计算的振动展宽已经大于实验的总展宽了,那么不管怎么调SpecHwHm都无法让计算和实验相符,因为SpecHwHm不能是负的。
所以计算重复出来实验的FWHM确实可以说明计算结果不是太离谱,没有显著高估振动展宽,但也就仅此而已了。换句话说不能证明几何结构优化的很合理,只能证明几何结构没出大问题
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