通过Forcite对石墨烯/有机物做限制性剪切，动力学平衡时化学键变的很长如何解决？

张张包 · 发表于 Post on 2022-4-2 15:59:50

各位老师，我想通过限制性剪切来模拟复合材料摩擦过程。发现动力学平衡后键变得很长，左图是我的操作步骤，右图是笔记本模拟的小体系，也出现了同样的问题。我觉得可能是第一步出了错误，但目前没想到解决办法，另外想请大家看看有没有可能是其他问题，或者模拟过程是否有不合理之处，请大家赐教，谢谢。

zyj19831206 · 发表于 Post on 2022-4-3 09:39:00

是不是中间体系没有退火？

AaronO_o · 发表于 Post on 2022-4-3 10:53:08

个人认为应当首先检查该部分（及其它所有部分）几何结构是否合理，如是否出现多余/丢失原子（复制粘贴结构时容易出现）、错误连接原子（自动成键时容易出现）等问题；
随后参考Forcite->Calculate->Energy下Forcefield右侧More中力场描述，在运算后的模型中检查是否符合该部分所有原子应有的力场类型（自动分配力场类型可能不合适），并检查电荷分配是否有明显的不合理（这一点可能并非主要影响因素）。

此外检查报表中，无定义的力场类型这一项也能有所帮助，用于判断这一C-O价键的立场类型是否合理。

张张包 · 发表于 Post on 2022-4-10 22:27:22

zyj19831206 发表于 2022-4-3 09:39
是不是中间体系没有退火？

退火了 NVT NPT都做了2ns

张张包 · 发表于 Post on 2022-4-10 22:31:10

AaronO_o 发表于 2022-4-3 10:53
个人认为应当首先检查该部分（及其它所有部分）几何结构是否合理，如是否出现多余/丢失原子（复制粘贴结构 ...

好的谢谢您的回复，获益良多。目前已经解决问题了，再次感谢！

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