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楼主 Author: qiyan
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[GROMACS] 模拟IL和水这种二元混合物气液界面体系,为什么水分子不能跑到真空区,如何处理

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-29 09:12:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-4-29 08:44
你先搜搜文献看别人蒸气压怎么模拟的

感谢老师回复,我看了一些文献,说计算获得体系的Pzz就是蒸汽压。我的疑问是,没有汽化的时候,真空区没有水分子的话,Pzz也能代表蒸汽压嘛

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发表于 Post on 2022-5-1 20:51:08 | 只看该作者 Only view this author
qiyan 发表于 2022-4-29 09:12
感谢老师回复,我看了一些文献,说计算获得体系的Pzz就是蒸汽压。我的疑问是,没有汽化的时候,真空区没 ...

"真空区没有水分子的话": 你算过密度分布,是严格为零么?还是随便看了几帧snapshot,没看到?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-2 09:36:26 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 qiyan 于 2022-5-3 08:25 编辑
bobosiji 发表于 2022-5-1 20:51
"真空区没有水分子的话": 你算过密度分布,是严格为零么?还是随便看了几帧snapshot,没看到?

感谢老师的回答,是的,在不产生汽化的情况下z轴密度分布在真空区是严格为0的。如果汽化就不为0了。老师您能解答一下,像我做离子液体和水体系,正常400k大概0.8bar达到气液相平衡,那我做slab后nvt模拟400K,体系是不会汽化的,z轴的气相区密度为0,这时的Pzz可以代表蒸汽压嘛。或者我该怎么处理让他汽化呢(sob老师说提高温度才会汽化,但是我想要400K下的蒸汽压),希望老师可以解答一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-3 17:40:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 qiyan 于 2022-5-3 17:42 编辑
sobereva 发表于 2022-4-29 08:44
你先搜搜文献看别人蒸气压怎么模拟的

十分不好意思再次打扰老师,老师我想获得像这种图片上温度的蒸汽压,但是通过模拟我发现slab后这个温度下我做的IL和水根本不会汽化,而实验是降压降到很低产生汽化得到蒸汽压,那我想问一下老师,我这种slab后nvt不能改变压力啊,他就不会汽化,那真空区的Pzz能代表气相压力吗,不能我该怎么处理呢,希望老师有时间回答一下,非常感谢老师

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发表于 Post on 2022-5-12 20:46:19 | 只看该作者 Only view this author
qiyan 发表于 2022-5-2 09:36
感谢老师的回答,是的,在不产生汽化的情况下z轴密度分布在真空区是严格为0的。如果汽化就不为0了。老师 ...

我知道有用gibbs ensemble MC模拟蒸汽压的,没见过跑md模拟的。。。

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