求助：使用Gromacs模拟双链DNA后轨迹处理问题

xuhuiting · 发表于 Post on 2023-8-6 09:52:28

HZW 发表于 2022-5-24 10:57
前天试过了，用-pbc mol处理后的轨迹虽然没有完整的双链结构，但是单条链是完整的，然后用-pbc nojump处 ...

我模拟DNA遇到一模一样的问题，请问你是怎么解决的？

tzypla · 发表于 Post on 2025-2-15 20:44:42

HZW 发表于 2022-5-24 10:57
前天试过了，用-pbc mol处理后的轨迹虽然没有完整的双链结构，但是单条链是完整的，然后用-pbc nojump处 ...

请问你解决了DNA链分开的情况吗？能不能分享一下是怎么解决的

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[GROMACS] 求助：使用Gromacs模拟双链DNA后轨迹处理问题