“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办,这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会!请点击此链接查看详情和报名方式,欢迎参加!

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会!报名正在进行中,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3581|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[建模与可视化] SambVca有人用过吗?求助一点问题

[复制链接 Copy URL]

70

帖子

0

威望

668

eV
积分
738

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本人研究茂金属配合物,领域内有人使用过SambVca这一工具。我有一个不明白的点就是如何加虚原子在茂环的中心处。我不能按照GaussView那样选定茂环的五个点然后添加一个中心原子。如果哪位用过这一程序恳请给予一些指导,谢谢!
https://www.molnac.unisa.it/OMtools/sambvca2.1/index.html

7

帖子

0

威望

239

eV
积分
246

Level 3 能力者

2#
发表于 Post on 2022-8-12 16:29:41 | 只看该作者 Only view this author
可以在熟悉的可视化界面程序里手动加一个原子,这个原子就是中心原子想要的位置,然后传上去,delete原子的步骤的时候删除它就能得到想要的Vbur。
如果熟悉Python 可以使用Morfeus包 里面也有求Vbur的功能 github:https://github.com/kjelljorner/morfeus 文档地址:https://kjelljorner.github.io/morfeus/buried_volume.html

70

帖子

0

威望

668

eV
积分
738

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-17 16:54:29 | 只看该作者 Only view this author
sjsjsj25915302 发表于 2022-8-12 16:29
可以在熟悉的可视化界面程序里手动加一个原子,这个原子就是中心原子想要的位置,然后传上去,delete原子的 ...

感谢回答,新版的SambVca可以在五元环中心处加标记,问题已经解决了。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-23 20:14 , Processed in 0.781770 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list