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[GROMACS] gromacs中做径向分布函数时候怎么生成索引文件

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体系里边有钙离子和硫酸根离子还有水,想分析钙离子和硫酸根中的硫的径向分布函数
按教程走的,但是索引编辑器一直出不来,不知道怎么给离子分组。图一是作业出错提示,图二是提交命令 ,图三是ndx脚本



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发表于 Post on 2022-5-24 03:18:01 | 只看该作者 Only view this author
make_ndx是交互式程序,根本不应当以提交方式运行
直接运行gmx make_ndx,手动敲命令
诸如此类根本没有计算耗时的任务直接在本机运行就完了

如果当前机子是Windows而且还没装gmx,直接用下文提供的现成的
GROMACS的原生Windows版的编译和安装方法(支持GPU加速)
http://sobereva.com/458http://bbs.keinsci.com/thread-11848-1-1.html

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-24 09:02:31 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-24 10:14:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 小柏桐 于 2022-5-24 10:24 编辑

老师,不好意思,我仔细看了您发的教程,刚刚的问题会了,但是撤回不了了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-24 10:47:39 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 小柏桐 于 2022-5-24 10:54 编辑

老师,我在开始菜单没找到 visual studio tools,我就打考了 visual studio 2022  Developer PowerShell for VS 2022,然后怎么运行fftw命令啊,还有就是运行命令最后的 visual studio 16 2019,这个16是什么意思啊,如果我换成visual  studio 2022,后边16要换吗




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