计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 12415|回复 Reply: 48
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[xtb] xtb 6.5.0 发布了(2024更新6.7.0)

  [复制链接 Copy URL]

320

帖子

1

威望

5357

eV
积分
5697

Level 6 (一方通行)

本帖最后由 paramecium86 于 2024-3-6 22:40 编辑

03/06/2024 官网更新6.7.0版
链接:https://pan.baidu.com/s/1A2KnPw7SM26tgoufoOWn2A?pwd=lytu
提取码:lytu
win版重新打包已经放入crest  
*********************************************************

*********************************************************

08/01/2023 官网更新了6.6.1版,win版经测试没有问题可以使用。
链接:https://pan.baidu.com/s/1A9lubANnLVqEnx5Cp0H4dg?pwd=u4qj
提取码:u4qj

**********************************************************
**********************************************************
07/26/2023 更新
官网重新更新了 6.6.0 win版的xtb程序。我试了几个任务都没啥问题。
压缩包里我把crest直接放进去了。直接设置好环境变量就可以用了。

链接:https://pan.baidu.com/s/1gJrTxwvr15N6GQzc-7kKcw?pwd=v5bm
提取码:v5bm


**********************************************************

**********************************************************
03/16/2022更新
官网已经删除预编译的6.6.0 win版xtb程序。有bug无法使用。
**********************************************************

02/11/2023 更新
xtb 6.6.0 官网上已经更新。更新网盘链接

链接:https://pan.baidu.com/s/18E8SDDUrBQdSZKOeBLvdIA?pwd=zn3h
提取码:zn3h
--来自百度网盘超级会员V9的分享


New features
  • Usage of an ideal conductor in ddCOSMO and the writing of COSMO files with xTB ([color=var(--color-accent-fg)]#705)
  • ONIOM ([color=var(--color-accent-fg)]#673, [color=var(--color-accent-fg)]#713, [color=var(--color-accent-fg)]#714, [color=var(--color-accent-fg)]#763)
  • A generic docking algorithm (aISS) ([color=var(--color-accent-fg)]#677, [color=var(--color-accent-fg)]#716)
  • --json option for GFN-FF ([color=var(--color-accent-fg)]#750, [color=var(--color-accent-fg)]#758)
  • Option to force the writing of mdrestart files at each dump step ([color=var(--color-accent-fg)]#760)
  • IR module for DFTB+ output ([color=var(--color-accent-fg)]#704)
  • Integrate tblite library for evaluating xTB Hamiltonians ([color=var(--color-accent-fg)]#626)


***********************************************
07/17/2022 更新
xtb 6.5.1官网上已经更新。
应坛友回帖要求。上传论坛大佬以前编译的的crest(非最新版)
我是直接放在xtb/bin 下 之后直接在环境变量里加上crest.exe的路径就可以任意路径调用了。

***********************************************
无意中发现
xtb 6.5.0发布了。
有官方的win版了。

https://github.com/grimme-lab/xtb/releases/tag/v6.5.0

release notes:
New features
  • Implemented ORCA Hessian for thermo submodule ([color=var(--color-accent-fg)]#504)
  • Add Oniom calculator ([color=var(--color-accent-fg)]#573, [color=var(--color-accent-fg)]#574, [color=var(--color-accent-fg)]#577, [color=var(--color-accent-fg)]#581, [color=var(--color-accent-fg)]#578)
  • Use [color=var(--color-accent-fg)]mctc library for geometry input / output, ([color=var(--color-accent-fg)]#591, [color=var(--color-accent-fg)]#594, [color=var(--color-accent-fg)]#592)
    support QCSchema JSON, QChem molecule files and FHI-aims geometry.in inputs
  • Allow printing of GFN-FF topology lists ([color=var(--color-accent-fg)]#545, [color=var(--color-accent-fg)]#570)
  • Add parameters for GFN1(Si)-xTB ([color=var(--color-accent-fg)]#550)
  • Added C API option to call gradient calculations on point charges ([color=var(--color-accent-fg)]#584)
  • Writing GFN-FF adjacency to output ([color=var(--color-accent-fg)]#497)
  • Implement script driver ([color=var(--color-accent-fg)]#579)
  • Reparametrization of Pt in Toluene for ALPB. ([color=var(--color-accent-fg)]#524)

初步测了测官方的win版。看起来是比6.4的win版快些。

***********************win版安装**********************************
环境变量设置(win10):
右键点击左下角 “开始”--->“System”------>右边栏“Advance system settings”----------- > "Enviroment variables"

新添加两个变量
XTBPATH    值设置成 xtb文件夹中的 share\xtb
OMP_NUM_THREADS  MKL_NUM_THREADS   这俩值分别是运行xtb时并行核心数,和调用数学库并行时候的核心数。

另外需要在Path中添加 xtb文件夹内bin文件夹的路径。

设置如图所示










环境变量1.png (66.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 99)

环境变量1.png

环境变量2.png (61.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 58)

环境变量2.png

crest.zip

6.59 MB, 下载次数 Times of downloads: 268

评分 Rate

参与人数
Participants 12
eV +58 收起 理由
Reason
cokie + 5 谢谢分享
杨bb + 4 牛!
Antonia + 4 赞!
zsu007 + 5 谢谢分享
GHL + 5 好物!
harrisonmo + 5 GJ!
muuu2333 + 5 好物!
panernie + 5 好物!
ezez + 5 赞!
lonemen + 5 GJ!
Acee + 5 好物!
乐平 + 5 谢谢分享

查看全部评分 View all ratings

24

帖子

0

威望

79

eV
积分
103

Level 2 能力者

2#
发表于 Post on 2022-6-1 16:01:53 | 只看该作者 Only view this author
等各位大佬出个官方win版的教程

320

帖子

1

威望

5357

eV
积分
5697

Level 6 (一方通行)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-1 16:08:14 | 只看该作者 Only view this author
无敌菠萝派 发表于 2022-6-1 16:01
等各位大佬出个官方win版的教程

好像也不需要什么特别的安装教程。。就是把xtb/bin里的xtb.exe 的路径加进环境变量里就行了。就能命令行里直接调用了。

187

帖子

1

威望

1247

eV
积分
1454

Level 4 (黑子)

4#
发表于 Post on 2022-6-1 16:11:42 | 只看该作者 Only view this author
Para老师好快呀!
计算小白 水平很菜
随时可喷 万望指点

24

帖子

0

威望

79

eV
积分
103

Level 2 能力者

5#
发表于 Post on 2022-6-1 16:32:36 | 只看该作者 Only view this author
paramecium86 发表于 2022-6-1 16:08
好像也不需要什么特别的安装教程。。就是把xtb/bin里的xtb.exe 的路径加进环境变量里就行了。就能命令行 ...

好的,谢谢指教

353

帖子

1

威望

1973

eV
积分
2346

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2022-6-1 23:07:53 | 只看该作者 Only view this author
paramecium86 发表于 2022-6-1 16:08
好像也不需要什么特别的安装教程。。就是把xtb/bin里的xtb.exe 的路径加进环境变量里就行了。就能命令行 ...

应该还要设置XTBPATH指向XTBROOT\share\xtb,不然GFN-0找不到参数(至少旧版本是这样)。另外并行相关的OMP_NUM_THREADS和MKL_NUM_THREADS也要设置

320

帖子

1

威望

5357

eV
积分
5697

Level 6 (一方通行)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-2 00:03:22 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-6-1 23:07
应该还要设置XTBPATH指向XTBROOT\share\xtb,不然GFN-0找不到参数(至少旧版本是这样)。另外并行相关的O ...

嗯嗯 是的。谢谢提醒。我在帖子里补充了如何设置这几个环境变量。

37

帖子

1

威望

1703

eV
积分
1760

Level 5 (御坂)

8#
发表于 Post on 2022-6-2 00:14:22 | 只看该作者 Only view this author
可不可以直接使用lyj714编译的xtb6.4.0中的cmd.bat文件用在官网的6.5.0版本中呢
cmd.bat

@echo off

rem for cp -r and rm -rf command with wildcard * (slower than linux)
rem maybe diffcult for creating C/Fortran interface instead of it
rem although I think the best way is to use SHFileOperation function
set PATH=%PATH%;%~dp0\bin;%~dp0\bin\bash

rem for xtb openmp stack size
set OMP_STACKSIZE=4G
set XTBPATH=%~dp0\share\xtb

rem for openmp threads, you can set it
set OMP_NUM_THREADS=8

rem start a cmd console on Desktop
cd /d %userprofile%\Desktop & start cmd

320

帖子

1

威望

5357

eV
积分
5697

Level 6 (一方通行)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-2 03:01:05 | 只看该作者 Only view this author
qlyfe 发表于 2022-6-2 00:14
可不可以直接使用lyj714编译的xtb6.4.0中的cmd.bat文件用在官网的6.5.0版本中呢
cmd.bat

倒是也没啥不行。毕竟就是在当前的cmd窗口设置好临时环境变量。把bat文件里对应位置的变量设置成6.5.0的路径就可以了。

72

帖子

0

威望

936

eV
积分
1008

Level 4 (黑子)

10#
发表于 Post on 2022-6-2 22:13:37 | 只看该作者 Only view this author
等一手win版教程,para老师

353

帖子

1

威望

1973

eV
积分
2346

Level 5 (御坂)

11#
发表于 Post on 2022-6-2 22:34:25 | 只看该作者 Only view this author
18392667184 发表于 2022-6-2 22:13
等一手win版教程,para老师

贴主已经写的很清楚了...你看上面那一大串**********************************

245

帖子

0

威望

2574

eV
积分
2819

Level 5 (御坂)

12#
发表于 Post on 2022-6-2 23:44:16 | 只看该作者 Only view this author
多谢多谢,如此详细的安装教程

68

帖子

0

威望

3449

eV
积分
3517

Level 5 (御坂)

13#
发表于 Post on 2022-6-9 22:54:16 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-6-1 23:07
应该还要设置XTBPATH指向XTBROOT\share\xtb,不然GFN-0找不到参数(至少旧版本是这样)。另外并行相关的O ...

请问,大神您做楼主的那个帖子里OMP_NUM_THREADS=8,1这里的1表示什么?
另,期待大神把新版的crest给编译成win版。

22

帖子

0

威望

207

eV
积分
229

Level 3 能力者

14#
发表于 Post on 2022-6-10 11:24:18 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Chela 于 2022-6-10 16:54 编辑
snljty2 发表于 2022-6-1 23:07
应该还要设置XTBPATH指向XTBROOT\share\xtb,不然GFN-0找不到参数(至少旧版本是这样)。另外并行相关的O ...

各位老师,请问我设置好环境变量之后,运行xtb闪退是什么原因?另外,我看到楼主贴的图片里环境变量设置了crest,我下载的安装里bin文件夹下并没有crest.exe,是我下载的安装包不对吗?
我下载的是[color=var(--color-accent-fg)]xtb-6.5.0-windows-x86_64.zip这个压缩包。

320

帖子

1

威望

5357

eV
积分
5697

Level 6 (一方通行)

15#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-11 07:06:24 | 只看该作者 Only view this author
Chela 发表于 2022-6-10 11:24
各位老师,请问我设置好环境变量之后,运行xtb闪退是什么原因?另外,我看到楼主贴的图片里环境变量设置 ...

没有。我用的还是之前论坛里大神编译的老版本crest。 虽然crest版本是老的但是一样可以调用新版的xtb跑构象搜索,批量优化什么的。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 13:06 , Processed in 0.191583 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list