简单谈谈GROMACS模拟重复性的问题

BobXu · 发表于 Post on 2023-10-30 19:31:03

sob老师说的太好了，我偶然一个MD的结果特别符合我预期，然后我用产物生成前的结果，重复一遍。然而，始终跑不出来那一次跑的结果，后面重复了好几次都没跑出来漂亮的结果

π大星 · 发表于 Post on 7 day ago

请教一下，我在生产模拟的时候一般并没有启用随机数种子（gen-vel=no），重复实验的时候我看到sob老师说gen-vel设置为yes就好了，那最开始的生产模拟是否有必要设置为yes启用随机数种子，谢谢大佬

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[GROMACS] 简单谈谈GROMACS模拟重复性的问题