求助计算不同晶型的阿司匹林HOMO-LUMO gap

wzkchem5

snljty2 发表于 2022-6-19 03:24
不行。XRD明显严重低估X-H键键长。只有中子衍射的才能直接用。看卢老师博文《实验测定分子结构的方法以及 ...

最近有一种方法NoSpherA2（https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2021/SC/D0SC05526C）可以从XRD数据解出准确的氢原子位置。一般解晶体是把分子的密度近似成原子密度的叠加，之所以氢原子解不准，主要是因为这个近似对氢原子来说很差。NoSpherA2考虑了原子密度在分子环境里的形变，所以键长精度极其高，即使对于氢原子也可以准到小数点后第3位，其他原子更是可以准到小数点后第4位。所以将来如果NoSpherA2能普及的话，可能就不用优化晶体结构了，即使氢也不用优化。
当然，如果晶体结构不是用NoSpherA2解的，那么还是要优化氢原子的。

knight1014

snljty2 发表于 2022-6-19 16:35
也得看XRD的解析度高低，以及晶体长得有多规整。

热椭球很畸形的原子可以优化，但热椭球很标准的原子位置是很精确的不需要优化。