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[GROMACS] 模拟分子在溶剂中的荧光发射光谱相关的数据的问题

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想模拟分子在溶剂中的荧光发射光谱相关的数据,在考虑是不是应该用这个分子的激发态作为初始构建体系的结构,如果是的话,那么这个激发态结构和相对应的电场参数应该怎么获取?



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发表于 Post on 2022-6-23 19:22:16 | 只看该作者 Only view this author
我不知道你想怎么模拟
如果就是以一般方式通过量化就是来模拟,下文明确说了做法
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314http://bbs.keinsci.com/thread-2413-1-1.html
此时不牵扯到“相对应的电场参数”

不知道你说电场是要做什么,以及为什么你选的是GROMACS分类,没看出你的问题和GROMACS能有什么联系。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-23 19:26:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-23 19:22
我不知道你想怎么模拟
如果就是以一般方式通过量化就是来模拟,下文明确说了做法
Gaussian中用TDDFT计算 ...

因为我之前想通过gromacs模拟计算这个体系中,溶剂效应导致分子产生的电场强度。然后现在想看这个电场强度和荧光光谱之间的关系,所以想知道需不需要用激发态结构去做模拟?

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发表于 Post on 2022-6-23 22:09:18 | 只看该作者 Only view this author
yuyao_yang 发表于 2022-6-23 12:26
因为我之前想通过gromacs模拟计算这个体系中,溶剂效应导致分子产生的电场强度。然后现在想看这个电场强 ...

是溶剂分子产生的电场在溶质分子处的强度,还是溶质分子产生的电场在溶剂分子处的强度,还是【存在溶剂条件下溶质的电场强度】和【不存在溶剂条件下溶质的电场强度】之差?
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-24 12:11:19 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-23 22:09
是溶剂分子产生的电场在溶质分子处的强度,还是溶质分子产生的电场在溶剂分子处的强度,还是【存在溶剂条 ...

嗯嗯,是存在溶剂条件下溶质的电场强度

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发表于 Post on 2022-6-24 14:51:45 | 只看该作者 Only view this author
yuyao_yang 发表于 2022-6-24 05:11
嗯嗯,是存在溶剂条件下溶质的电场强度

那是溶质在某一点的电场强度,还是在整个空间里的电场强度,还是在溶剂分子处的电场强度?
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-6-25 16:27:52 | 只看该作者 Only view this author
yuyao_yang 发表于 2022-6-23 19:26
因为我之前想通过gromacs模拟计算这个体系中,溶剂效应导致分子产生的电场强度。然后现在想看这个电场强 ...

这个问题很奇怪
影响溶质发光特征的是溶剂对溶质产生的电场,你却要计算溶质产生的电场,搞不清楚到底是个什么idea
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