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[GROMACS] 蛋白PDB文件的羧基OXT在Gromacs运行下变成O1和O2

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求助!模拟小白,请教一下,蛋白复合物初始PBD的羧基端是OXT,在pdb2gmx后 变成了 O1和O2;由于本人想使用gmx_MMPBSA做Decomposition_analysis计算残基的MMPBSA,但是一直报错,如下




请问怎么解决,谢谢了!

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发表于 Post on 2022-6-26 00:05:21 | 只看该作者 Only view this author
搞明白tdb文件是干嘛的


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-26 08:32:38 | 只看该作者 Only view this author
真心谢谢您!

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