求体系芳香性

一直走 · 发表于 Post on 2016-4-27 15:17:45

请问想算一个体系的芳香性，应该在gaussian的输入文件中如何设置？

小范范1989 · 发表于 Post on 2016-4-27 15:22:37

http://sobereva.com/176

一直走 · 发表于 Post on 2016-4-27 15:34:57

小范范1989 发表于 2016-4-27 15:22
http://sobereva.com/176

很受用，谢谢~

一直走 · 发表于 Post on 2016-4-27 16:09:13

小范范1989 发表于 2016-4-27 15:22
http://sobereva.com/176

还有一个问题，就是在链接里用NICS衡量时涉及的基本是环形或平面曲面的体系，如果我想算一个球形的体系，是否应该在球心加一个虚原子算NICS,还是在离球中心垂直距离为1诶处加虚原子算呢，毕竟有的认为NICS(0)有时候不准确~

小范范1989 · 发表于 Post on 2016-4-27 20:34:35

一直走发表于 2016-4-27 16:09
还有一个问题，就是在链接里用NICS衡量时涉及的基本是环形或平面曲面的体系，如果我想算一个球形的体系， ...

这个不懂，我当时用的时候，就是用到了里面两种方式，其他的没怎么研究，还是等sob老师吧。哈哈哈

一直走 · 发表于 Post on 2016-4-27 20:52:25

小范范1989 发表于 2016-4-27 20:34
这个不懂，我当时用的时候，就是用到了里面两种方式，其他的没怎么研究，还是等sob老师吧。哈哈哈

好的，我貌似从你的链接里了解到了一点，我可以试试，谢谢了

sobereva · 发表于 Post on 2016-4-28 04:04:32

一直走发表于 2016-4-27 16:09
还有一个问题，就是在链接里用NICS衡量时涉及的基本是环形或平面曲面的体系，如果我想算一个球形的体系， ...

算NICS不是加虚原子而是加鬼原子
怎么加取决于你着重讨论什么
距离中心1埃处设Bq不会有什么意义。
三维体系可使用AICD或者ICSS研究，更为全面，见

使用AICD程序研究电子离域性和磁感应电流密度
http://sobereva.com/147
通过Multiwfn绘制等化学屏蔽表面(ICSS)研究芳香性
http://sobereva.com/216

一直走 · 发表于 Post on 2016-4-28 08:50:21

sobereva 发表于 2016-4-28 04:04
算NICS不是加虚原子而是加鬼原子
怎么加取决于你着重讨论什么
距离中心1埃处设Bq不会有什么意义。

好的，谢谢老师~

一直走 · 发表于 Post on 2016-4-28 16:28:10

sobereva 发表于 2016-4-28 04:04
算NICS不是加虚原子而是加鬼原子
怎么加取决于你着重讨论什么
距离中心1埃处设Bq不会有什么意义。

Bq 0.000000 -2.155707 -0.338053
Bq 0.000000 0.000000 0.859657
其中Bq代表虚原子，这使得Gaussian输出这些位置的NMR信息。然后Route Section部分写上NMR关键词，以及所用理论方法、基组，然后开始运算即可。
以上是Sob老师博客中写到的关于NICS的一部分，这里所说的虚原子与您说的鬼原子是一个性质吗？

sobereva · 发表于 Post on 2016-4-29 01:43:28

一直走发表于 2016-4-28 16:28
Bq 0.000000 -2.155707 -0.338053
Bq 0.000000 0.000000 0.859657
其中Bq代表虚原子，这使得Gaussian ...

虚原子是X，仅用于描述结构时候定位用。鬼原子是Bq，用于做counterpoise校正、指定NICS计算位置等目的。

一直走 · 发表于 Post on 2016-4-29 11:07:48

sobereva 发表于 2016-4-29 01:43
虚原子是X，仅用于描述结构时候定位用。鬼原子是Bq，用于做counterpoise校正、指定NICS计算位置等目的。

好的，我会继续了解，谢谢老师

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